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11石宝

新虫 (小有名气)

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[求助] 鉴定新种已有2人参与

哪里做DNA杂交鉴定新种比较靠谱？？？标准菌株已经购买了，SOS

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1楼 2016-12-22 15:26:57

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11石宝

新虫 (小有名气)

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引用回帖:

10楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-27 11:15:59
你需要确定的是，genebank中是否有与你的物种同类的标准菌株；其次，你购买的标准菌株是否与自己的同种（如果genebank中没有该物种的标准基因组）
我还是建议，首先你自己的菌测草图比对genebank，看是否有同种的 ...

genbank上只有该标准菌株Piscinibacter defluvii的16s rDNA序列，也是今年才在IJSEM上发文章，认为是新种菌，我之前买了另一株和我相似最高的标菌Piscinibacter aquaticus，结果采购回来后，发现IJSEM已经发表了菌株Piscinibacter defluvii，而Piscinibacter defluvii和我的菌的16s rDNA相似度更高。之前咨询过草图大概是4000-5000，如果我要测两个菌的草图，还不如做一对DNA杂交划算。