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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】加溶剂效应后，相应的势垒增大了怎么解释？
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vallen

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】加溶剂效应后，相应的势垒增大了怎么解释？

一个审稿人的意见

Table 1 shows that PCM model raises the activation energies by a few kcal/mol for the relevant proton transfer processes; however the inclusion of only one water molecule significantly decreases the activation energies. Such contradiction rarely appears to my knowledge. To further discuss bulk solvent effect, the author may try PCM again for the monohydrated  species.

应该怎么给他解释？

[ Last edited by erylingjet on 2008-12-9 at 19:51 ]
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1楼 2008-12-09 19:38:14
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dolphin618

金虫 (正式写手)
★ ★
yyx19840628(金币+2,VIP+0):谢谢参与讨论
我猜想，有可能楼主先做的气相反应计算，再进行PCM计算，不知道楼主气相反应中使用的是质子还是水合氢离子，也有可能是因为，水对质子的吸引能力比反应物的能力强，导致能垒升高，这种情况对于葡萄糖降解反应中是存在的，只是不知道楼主做的什么什么反应体系
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生命本就是不可名说的缘法，可又有谁愿做菩提下微笑拈起的莲花？
7楼2008-12-11 14:17:45
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dolphin618

金虫 (正式写手)
★
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢！
感觉和我做的很相像啊，我们可以讨论一下
对于这个问题，我觉得你说的不是很清楚，一是大家不明白你做的是什么体系，含有什么样的过渡态，只知道含有hydrogen transfer，二是不知道你的溶剂是什么啊，是水还是其他的什么溶剂
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生命本就是不可名说的缘法，可又有谁愿做菩提下微笑拈起的莲花？
2楼2008-12-10 08:23:21
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cysqxr

木虫 (小有名气)
★ ★
gwdavid(金币+2,VIP+0):谢谢关注
先问几个问题
1：你的PCM采用的是PCM单点计算，还是PCM的优化？
2：你采用的PCM model（包括空穴） and solvent分别是什么？
3：你的体系是中性体系还是正电体系？
4：你的位垒是多少，变化了多少？
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3楼2008-12-10 09:07:52
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vallen

银虫 (正式写手)
1. 单点算
2. uahf, H2O
3. 体系有一个负电荷
4.加pcm后势垒增加了大约3kcal/mol
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4楼2008-12-10 11:54:55
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