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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yj112358

新虫 (小有名气)

[求助] NAMD在体系两端加真空层后,跑nvt,体系扩散严重怎么办啊?

NAMD在体系两端加真空层后,跑nvt,体系扩散严重怎么办啊?还有我是在配置文件中周期边界条件那里将Z方向尺寸加大,达到在Z方向加真空层的目的,这样做合理吗?

# Periodic Boundary conditions
# NOTE: Do not set the periodic cell basis if you have also
# specified an .xsc restart file!
if {1} {
cellBasisVector1    30.0  0    0
cellBasisVector2     0   30.0  0
cellBasisVector3     0    0   70
cellOrigin           15  15  35.56
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yj112358

新虫 (小有名气)

2楼2016-12-21 12:12:29
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