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yj112358

新虫 (小有名气)

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专业: 胶体与界面化学

[求助] NAMD在体系两端加真空层后，跑nvt，体系扩散严重怎么办啊？

NAMD在体系两端加真空层后，跑nvt，体系扩散严重怎么办啊？还有我是在配置文件中周期边界条件那里将Z方向尺寸加大，达到在Z方向加真空层的目的，这样做合理吗？

# Periodic Boundary conditions
# NOTE: Do not set the periodic cell basis if you have also
# specified an .xsc restart file!
if {1} {
cellBasisVector1 30.0  0 0
cellBasisVector2    0 30.0  0
cellBasisVector3    0 0 70
cellOrigin          15  15  35.56

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1楼 2016-12-20 22:04:43

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yj112358

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2楼2016-12-21 12:12:29

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