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keeglin

金虫 (正式写手)

[求助] 求助大神，结构优化怎么做 已有1人参与

由于时间比较紧张，现在急需找个大神帮忙指导一下，如何优化带苯环的分子与CH4分子作用时候究竟和哪个键产生作用这种结构？高斯小白跪谢各位
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1楼 2016-12-20 11:15:49
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
keeglin: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 特别感谢！ 2016-12-20 21:45:38
带苯环的分子与CH4分子作用，应是范德华作用，需要用DFT-D这样的方法。
二者对接的部位，应该有两种方式：
1、在平面上，在没有空间障碍的情况下，苯环的两个H与CH4的两个H在平面上对接，双方H与H距离2.8埃，然后优化。
2、在没有空间障碍的情况下，在苯环的上方中间，安排CH4，进行优化。
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2楼2016-12-20 16:56:39
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keeglin

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-12-20 16:56:39
带苯环的分子与CH4分子作用，应是范德华作用，需要用DFT-D这样的方法。
二者对接的部位，应该有两种方式：
1、在平面上，在没有空间障碍的情况下，苯环的两个H与CH4的两个H在平面上对接，双方H与H距离2.8埃，然后 ...

再问一下，如果苯环上还有氨基，和羟基，怎么处理呢？
连有氨基和羟基的苯环，和水分子作用的时候，羟基与水分子形成氢键，这个又是怎么处理呢？
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3楼2016-12-20 21:50:11
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keeglin

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-12-20 16:56:39
带苯环的分子与CH4分子作用，应是范德华作用，需要用DFT-D这样的方法。
二者对接的部位，应该有两种方式：
1、在平面上，在没有空间障碍的情况下，苯环的两个H与CH4的两个H在平面上对接，双方H与H距离2.8埃，然后 ...

刚接触这个软件，还请大神不要笑话我的问题比较白痴……如果可以的话，能否加个QQ，详细交流一下呢
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4楼2016-12-20 21:56:19
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