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周先森回家了

金虫 (著名写手)

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[求助] CINEB跑了500步不收敛

CINEB计算过渡态，我先介绍一下我的体系：初态是2-戊烯分子吸附在beta分子筛上，如图IS所示，双键的两个碳原子为标为C2 C3，酸性位上的H标为1，O标为4，另外一个O标为5，整个的反应过程是H1吸附在C3原子上，C2 C3之间的双键断开，C2原子与O5成键，末态如图FS所示。我的过渡态插入了5个点，初末态距离是6.9多，跑了500步目前还没有收敛，slurm文件最后的步数如第一个图所示，感觉是出问题了，01-05是我插入的构型的结构，现在我怀疑是不是插入的构型不正确，就拿04构型来说，C2是不饱和的，是不是需要在MS里面把C2 C3之间的键设置成partial double bond呢？（尝试着设置了一下，设不成呢怎么）图中的是单键，还是说就这样就可以，真心希望能得到做相似体系或者懂得的大神给指点一下，不胜感激！

slurm.png

IS.png

FS.png

01.png

02.png

03.png

04.png

05.png

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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）

1楼2016-12-07 10:20:42

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周先森回家了

金虫 (著名写手)

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引用回帖:

22楼: Originally posted by jackjiejl at 2016-12-12 08:00:24
VASP只能算周期性的啊，高斯算cluster模型，此外如果要搭建cluster现在MS make P1 一下就可以随便删了

恩恩，VASP适合算周期性模型，但是您那个帖子里面，用的感觉也是簇模型呢？http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=9551696，另外，还想请教一下，您是只做乙烯在分子筛上的吸附吗？我现在做的是烯烃异构化的机理研究，感觉跟您研究的有点相似，所以很感兴趣，想了解一下。也想了解一下跟这类似的这一块有哪些可以研究的点，想换个小方向研究。