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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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chemzhuhb

木虫 (小有名气)

[交流] 求助B类错误！

PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H3A    ..  H5A     ..       1.08 Ang.

这个错误可能是由于无序或加氢错误引发的。

由于H5A是羧基O5上的氢，由于我这个羧酸是手性羧酸，我怀疑这个氢应该加在这个羧基的O4上。
不知道我的猜测对不对，如果是这样，请问如何将O5上的氢去掉，而将氢加在O4上呢。
另外，还有两个G类错误，顺带请教学习下：
PLAT860_ALERT_3_G Note: Number of Least-Squares Restraints .......          2  
PLAT720_ALERT_4_G Number of Unusual/Non-Standard Labels ..........          1
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1楼 2008-12-05 22:11:20
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chemzhuhb

木虫 (小有名气)
Xi2004，先感谢一下。


G类两个错误给我回答的很清楚了。
但对B类错误的解答，我还有些疑问。

我的手性酸是手性苹果酸，H3A是是羟基上的氢，H5A是羧基上的氢。H3A和H5A是统计分布的吗，我不太理解。
如果说H5A在羧基的两个氧统计分布，这个是可以理解。
如果这个酸是非手性的，那么我觉得H5A在羧基的两个氧统计分布概率是等同的。但如果酸是手性的，由于立体环境的不对称，H5A可能会偏向分布在羧基的其中一个氧上。所以我才猜测B类错误是由于羧基氧上的氢加错引起的。欢迎继续指正。

言归正传，我希望知道如何将O5上的氢去掉，而将O4上加上氢（O4，O5为同一羧基的两个氧）。

再次感谢xi2004的帮助。
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2008-12-5 22:58:
两个氢实际上是一个, 要删掉其中的一个就好了. (其实真实情况可能是部分在H3A, 部分在H5A, 是统计分布的)
当然, 如果电荷不平衡, 要从别的地方找一个.

PLAT860_ALERT_3_G Note: Number of Least-Squares Res ...

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3楼2008-12-06 10:23:35
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
waiy2001(金币+1,VIP+0):谢谢解答
两个氢实际上是一个, 要删掉其中的一个就好了. (其实真实情况可能是部分在H3A, 部分在H5A, 是统计分布的)
当然, 如果电荷不平衡, 要从别的地方找一个.

PLAT860_ALERT_3_G Note: Number of Least-Squares Restraints .......          2  
用了2个restrains,  自动产生的, 不用管

PLAT720_ALERT_4_G Number of Unusual/Non-Standard Labels ..........          1
有写原子名plation不喜欢, 不如H1WA之类的, 改一下名就好了.
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xi2004-emuch@163.com
2楼2008-12-05 22:58:11
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
warlen(金币+1,VIP+0):多谢应助！
这个要看你的具体数据.
如果你的数据很好, 则可以相信差Fourier图得到的氢.
你现在的情况是不是O4旁没有可以加为氢的峰?

羟基是不是和O5形成分子间氢键? 如果是, 则氢的位置在两个氧之间大一定距离内变化, 形成统计是很正常的吧?
羧基氧哪个有氢, 还要看C-O的距离.
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xi2004-emuch@163.com
4楼2008-12-06 10:59:17
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chemzhuhb

木虫 (小有名气)
受教了，谢谢！

O4旁没有可以加氢的峰。
可是我该如何解释这个B类错误呢？
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2008-12-6 10:59:
这个要看你的具体数据.
如果你的数据很好, 则可以相信差Fourier图得到的氢.
你现在的情况是不是O4旁没有可以加为氢的峰?

羟基是不是和O5形成分子间氢键? 如果是, 则氢的位置在两个氧之间大一定距离内变化, 形 ...

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5楼2008-12-06 12:21:14
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