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qac

金虫 (正式写手)

[交流] 问生物的朋友们一个问题

如果想知道某种蛋白质的结构式,应该去哪里查呢,比如,albumin白蛋白,卵清蛋白,蚕丝蛋白,木瓜蛋白酶等等
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zlp322

铜虫 (初入文坛)


qac(金币+1,VIP+0):谢谢,还是这里好人多啊
先找到该蛋白的英文名,比如木瓜蛋白酶为Papain,在NCBI Entrez中的搜索框中输入,选择搜索结果中的Protein就可以得到序列了。(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entr ... mp;doptcmdl=GenPept
5楼2008-12-06 09:00:03
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opq691

荣誉版主 (知名作家)

小木虫酱油店店主

优秀版主


qac(金币+1,VIP+0):谢谢!我只想知道大致的结构,比如分子有多大,主要基团是什么
蛋白质没有简单的结构式,都是大分子,生物化学书上有,可以看书
▄︻┳═一*▄︻┳═一*众里寻虫千百度,蓦然回首,虫在酱油坛深处!▄︻┳═一*▄︻┳═一*
2楼2008-12-04 18:42:13
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zlp322

铜虫 (初入文坛)


qac(金币+1,VIP+0):谢谢,可是我不知道氨基酸序列,只知道蛋白质的名字不可以吗
如果你知道蛋白的氨基酸序列的话可以先去可以去NCBI blastp(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAS ... &SEARCH_NAME=bp) 上面进行序列对比,找到相似的蛋白质,再进入RCSB PDB(http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)查找前人已测得的蛋白结构。
3楼2008-12-04 21:49:53
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zlp322

铜虫 (初入文坛)

★ ★
qac(金币+2,VIP+0):非常感谢!如果想看整个大蛋白的结构,有什么方法么
也可以,但是前人已测得的蛋白质氨基酸序列一般都只是你所说的“木瓜蛋白酶”“蚕丝蛋白”等大分子蛋白中的某个亚基,也就是只是其中的一部分序列。
4楼2008-12-05 20:25:05
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