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问生物的朋友们一个问题
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| 如果想知道某种蛋白质的结构式,应该去哪里查呢,比如,albumin白蛋白,卵清蛋白,蚕丝蛋白,木瓜蛋白酶等等 |
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opq691
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2楼2008-12-04 18:42:13
★
qac(金币+1,VIP+0):谢谢,可是我不知道氨基酸序列,只知道蛋白质的名字不可以吗
qac(金币+1,VIP+0):谢谢,可是我不知道氨基酸序列,只知道蛋白质的名字不可以吗
| 如果你知道蛋白的氨基酸序列的话可以先去可以去NCBI blastp(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAS ... &SEARCH_NAME=bp) 上面进行序列对比,找到相似的蛋白质,再进入RCSB PDB(http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)查找前人已测得的蛋白结构。 |
3楼2008-12-04 21:49:53
4楼2008-12-05 20:25:05
★
qac(金币+1,VIP+0):谢谢,还是这里好人多啊
qac(金币+1,VIP+0):谢谢,还是这里好人多啊
| 先找到该蛋白的英文名,比如木瓜蛋白酶为Papain,在NCBI Entrez中的搜索框中输入,选择搜索结果中的Protein就可以得到序列了。(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entr ... mp;doptcmdl=GenPept) |
5楼2008-12-06 09:00:03
shawcat
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6楼2008-12-06 10:22:46
7楼2008-12-06 17:47:45
8楼2008-12-06 21:52:11
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这个就是它的序列吧 1 mamipsiskl lfvaiclfvy mglsfgdfsi vgysqndlts terliqlfes wmlkhnkiyk 61 nidekiyrfe ifkdnlkyid etnkknnsyw lglnvfadms ndefkekytg siagnyttte 121 lsyeevlndg dvnipeyvdw rqkgavtpvk nqgscgscwa fsavvtiegi ikirtgnlne 181 yseqelldcd rrsygcnggy pwsalqlvaq ygihyrntyp yegvqrycrs rekgpyaakt 241 dgvrqvqpyn egallysian qpvsvvleaa gkdfqlyrgg ifvgpcgnkv dhavaavgyg 301 pnyiliknsw gtgwgengyi rikrgtgnsy gvcglytssf ypvkn 表示有300多个氨基酸这么排列构成的序列吧? |
9楼2008-12-06 22:12:14
10楼2008-12-06 22:13:29










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