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jondan

木虫 (著名写手)

应助: 75 (初中生)
金币: 3864
散金: 206
红花: 7
帖子: 2036
在线: 696.4小时
虫号: 1949752
注册: 2012-08-21
专业: 半导体材料

[求助] HSE 计算能带时提示segmentation fault？已有1人参与

用HSE06计算磁性元素的能带时，前面的PBE和HSE计算都没报错，计算能带时出错，而且是跑完第四个电子步时出错。计算态密度都不会出错。机子128G的。

running on 12 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 12 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found type information on POSCAR
POSCAR found :  4 types and 16 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew

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|                                                                            |
|          W W AA RRRRR N N  II  N N GGGG !!!          |
|          W W A  A R R  NN N  II  NN N  G G  !!!          |
|          W W  A A  R R  N N  N  II  N N  N  G    !!!          |
|          W WW W  AAAAAA  RRRRR N  N N  II  N  N N  G  GGG !          |
|          WW  WW  A A  R R N NN  II  N NN  G G             |
|          W W  A A  R R  N N  II  N N GGGG !!!          |
|                                                                            |
|    Your generating k-point grid is not commensurate to the symmetry    |
|    of the lattice.  This can cause slow convergence with respect       |
|    to k-points for HF type calculations                                  |
|    suggested SOLUTIONS:                                                 |
|    ) if not already the case, use automatic k-point generation          |
|    ) shift your grid to Gamma (G) (e.g. required for hex or fcc lattice) |
|                                                                            |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(          1 )
reading WAVECAR
entering main loop
   N    E                   dE          d eps    ncg    rms       rms(c)
DAV: 1    0.587893065932E+04 0.58789E+04 -0.18099E+05 21396 0.551E+03
DAV: 2    0.176374237326E+04 -0.41152E+04 -0.40139E+04 15300 0.180E+03
DAV: 3    0.427760916563E+03 -0.13360E+04 -0.12970E+04 16956 0.432E+02
DAV: 4    0.161401825874E+03 -0.26636E+03 -0.24833E+03 16176 0.213E+02
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 8 with PID 5971 on node node14 exited on signal 11 (Segmentation fault).
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hello

1楼 2016-11-27 15:17:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wobure

新虫 (小有名气)

应助: 14 (小学生)
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注册: 2014-06-11
性别: GG
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

引用回帖:

9楼: Originally posted by jondan at 2016-11-29 11:56:23
我是这样的感觉是编译问题真头疼怎样给你评分啊？你没选择应助啊...

你是非线性计算？一般不是编译问题吧。你试下这两步吧：
1）用relax的自动kpoints，开hse，非线性，提交计算几秒，得到IBZKPT后退出任务；
2）用刚得到的IBZKPT作为KPOINTS，并加入你想画能带的k点，权重设为0.重新提交计算。

跳过前面的pbe，hse，不读取wavecar。试试吧，不行我就不知道了，哈哈。
没分就没分吧^^