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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » HSE 计算能带时提示segmentation fault？
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jondan

木虫 (著名写手)

[求助] HSE 计算能带时提示segmentation fault？ 已有1人参与

用HSE06计算磁性元素的能带时，前面的PBE和HSE计算都没报错，计算能带时出错，而且是跑完第四个电子步时出错。计算态密度都不会出错。机子128G的。

running on   12 nodes
distr:  one band on    1 nodes,   12 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found type information on POSCAR  
POSCAR found :  4 types and   16 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      Your generating k-point grid is not commensurate to the symmetry       |
|      of the lattice.  This can cause   slow convergence with respect        |
|      to k-points for HF type calculations                                   |
|      suggested SOLUTIONS:                                                   |
|       ) if not already the case, use automatic k-point generation           |
|       ) shift your grid to Gamma (G) (e.g. required for hex or fcc lattice) |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...(           1 )
reading WAVECAR
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
DAV:   1     0.587893065932E+04    0.58789E+04   -0.18099E+05 21396   0.551E+03
DAV:   2     0.176374237326E+04   -0.41152E+04   -0.40139E+04 15300   0.180E+03
DAV:   3     0.427760916563E+03   -0.13360E+04   -0.12970E+04 16956   0.432E+02
DAV:   4     0.161401825874E+03   -0.26636E+03   -0.24833E+03 16176   0.213E+02
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 8 with PID 5971 on node node14 exited on signal 11 (Segmentation fault).
--------------------------------------------------------------------------
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hello
1楼 2016-11-27 15:17:53
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wobure

新虫 (小有名气)
根据本人经验，应该不是内存问题。
hse wavecar的读取及k点是要对应的。要么就读取charge画能带。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2016-11-28 07:38:46
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人
感觉像是内存不够了
赞一下 回复此楼
http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
2楼2016-11-27 19:31:58
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
像是内存溢出，可能不是物理内存大小的问题，你在环境变量中解除内存限制，或者在编译vasp的时候加个关键词就可了
赞一下 回复此楼
3楼2016-11-27 23:32:23
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jondan

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wobure at 2016-11-28 07:38:46
根据本人经验，应该不是内存问题。
hse wavecar的读取及k点是要对应的。要么就读取charge画能带。

同意wobure的回复，我感觉也不是内存问题，实时监控内存没超过50G（小于我的124G）。
1 hse wavecar的读取及k点是要对应的？  K点不是上一步HSE的IBZKPT加权重为0的高对称点组成吗？怎么对应？
2 要么就读取charge画能带？直接读取HSE产生的电荷按照正常的非自洽直接计算吗？
赞一下 回复此楼
hello
5楼2016-11-28 09:56:37
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