24小时热门版块排行榜    

查看: 1965  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

木小默1212

金虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质生物信息学分析 已有1人参与

我根据同源克隆得到一段DNA序列,之后将其利用软件翻译为相对应的蛋白质序列,现在想请问除了进行一般的进化树构建,多序列比对,跨膜结构预测,糖基化位点预测,CDD分析,密码子的分析,二级和三级结构的预测之外,我现在还有一下问题:


1      除了上述的相关生物信息学分析之外,还可以进行关于蛋白质或DNA的哪些生物信息学分析;



2     在进行二级结构预测的时候,如果采用PDBsum这个软件进行二级结构的预测,是否必须找到与我所得到的蛋白质大小相近的蛋白质进行二级结构预测;如果找不到与其大小相近的蛋白质,那么能否用与其大小不同但是具有同源的蛋白质进行预测,如果可以,那么得到的二级结构应该显示为与其同源蛋白质的二级结构,这样的结构图能否放在毕业论文中用以说明我的目的蛋白呢?



谢谢各位大侠!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

蛋白表达纯化鉴定精华

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yml11

新虫 (初入文坛)

请问你做二三级结构预测是用的什么软件呢?学习一下谢谢!

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-12-01 08:52:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

wywahh

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
木小默1212: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-11-29 09:23:31
分子量和等电点大小、亚细胞定位,一些同源基因的结构图、这些差不多了
2楼2016-11-28 19:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木小默1212

金虫 (初入文坛)

你好!我二级结构的预测用的是:
蛋白质二级结构预测(或检测)(热烈邀请大家补充)
http://bioms.org/forum.php?mod=viewthread&tid=593
(出处: 生物分子模拟论坛)
这里面提供了很多种方法,我试了试其中大部分的方法,你可以自己选择适合自己的。


三级结构预测的软件:
通过PHYRE 2 Protein Fold Recognition Server和伦敦帝国理工学院3D LigandSite server预测三级结构及活性中心。
三级结构的预测我还没有确定,因为我有些内容还没有做完。
4楼2016-12-01 10:48:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[基金申请] 国自科面上基金字体 +4 iwuli 2026-03-12 5/250 2026-03-15 17:07 by 风云无泪
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 332分材料工程调剂 +3 莓好时光海苔 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:03 by JourneyLucky
[考研] 328,0703考生求调剂,一志愿为东北师范大学 +4 观素律 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:24 by JourneyLucky
[考研] 考研材料与化工,求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:14 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中农业大学071010,总分三百二,求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:35 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +5 邱gl 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:37 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 +5 隔壁陈先生 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 7/350 2026-03-13 17:28 by xujiaoszu
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123! 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考研] 纺织、生物、化学、材料相关专业招生了 +4 耶耶业 2026-03-09 7/350 2026-03-12 19:05 by Equinoxhua
[考研] 一志愿:武汉理工,材料工程,英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
请填处理意见