应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？
51/1返回列表
查看: 1498  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fanofpal

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？ 已有2人参与

如题，小弟刚开始学习高分子聚合物的粗粒化建模，看文献中提到利用全原子模型的键角分布，通过Boltzmann inversion得到angle potential，下面是CG-PE系统的angle distribution和angle potential
请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？
一直百思不得其解，不知道是怎么个计算法？（参考文献是Coarse Graining of Short Polythylene Chains for Studying Polymer Crystallization）文献中提到的公式如下：
请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？-1
k是Boltzmann  Constant，P(θ)是全原子模型的键角分布，U0是一个参数用来使得trans-trans构象的势能为0。另一篇硕士论文给出了部分angle potential的表格
请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？-2
但我尝试直接带入全原子模型键角分布的某些值，并不能得到对应的势能。
第一次发帖求助，期望各位大佬来帮帮忙！可能我的理解有误，还请不吝赐教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2016-11-22 01:39:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有个叫votca的软件应该可以，具体怎么用不太清楚，你可以看看里面的粒子
赞一下 回复此楼
2楼2016-11-22 16:52:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青丘白浅

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你好楼主，请问这个问题解决了吗，目前我也面临着这个问题，另外想请教一下您知道CG-PE模型怎么构建吗，文献里一直说用蒙特卡洛方法随机生成自避行走链，但是具体构建思路我还是不大清楚，想请教一下，谢谢。
赞一下 回复此楼
3楼2017-10-08 22:04:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灯火阑珊wzm

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 青丘白浅 at 2017-10-08 22:04:10
你好楼主，请问这个问题解决了吗，目前我也面临着这个问题，另外想请教一下您知道CG-PE模型怎么构建吗，文献里一直说用蒙特卡洛方法随机生成自避行走链，但是具体构建思路我还是不大清楚，想请教一下，谢谢。

您好，请问您那找到CG-PE模型的建模方法了吗？有的话能不能分享一下，谢谢！
赞一下 回复此楼
4楼2019-03-04 09:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灯火阑珊wzm

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 青丘白浅 at 2017-10-08 22:04:10
你好楼主，请问这个问题解决了吗，目前我也面临着这个问题，另外想请教一下您知道CG-PE模型怎么构建吗，文献里一直说用蒙特卡洛方法随机生成自避行走链，但是具体构建思路我还是不大清楚，想请教一下，谢谢。

您好，请问您那找到CG-PE模型的建模方法了吗？有的话能不能分享一下，谢谢！
赞一下 回复此楼
5楼2019-03-04 09:36:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fanofpal 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 0703 物理化学调剂 +3 我可以上岸的对� 2026-03-13 5/250 2026-03-16 10:50 by 我可以上岸的对�
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy！ 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] 271求调剂 +10 生如夏花… 2026-03-11 10/500 2026-03-14 00:35 by 卖报员小雨
[考研] 招收0805（材料）调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考研] 一志愿：武汉理工，材料工程，英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭