应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？
51/1返回列表
查看: 1506  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fanofpal

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？ 已有2人参与

如题，小弟刚开始学习高分子聚合物的粗粒化建模，看文献中提到利用全原子模型的键角分布，通过Boltzmann inversion得到angle potential，下面是CG-PE系统的angle distribution和angle potential
请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？
一直百思不得其解，不知道是怎么个计算法？（参考文献是Coarse Graining of Short Polythylene Chains for Studying Polymer Crystallization）文献中提到的公式如下：
请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？-1
k是Boltzmann  Constant，P(θ)是全原子模型的键角分布，U0是一个参数用来使得trans-trans构象的势能为0。另一篇硕士论文给出了部分angle potential的表格
请问聚合物coarse grained model中所需的angle potential表格如何得到？-2
但我尝试直接带入全原子模型键角分布的某些值，并不能得到对应的势能。
第一次发帖求助，期望各位大佬来帮帮忙！可能我的理解有误，还请不吝赐教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2016-11-22 01:39:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有个叫votca的软件应该可以，具体怎么用不太清楚，你可以看看里面的粒子
赞一下 回复此楼
2楼2016-11-22 16:52:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青丘白浅

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你好楼主，请问这个问题解决了吗，目前我也面临着这个问题，另外想请教一下您知道CG-PE模型怎么构建吗，文献里一直说用蒙特卡洛方法随机生成自避行走链，但是具体构建思路我还是不大清楚，想请教一下，谢谢。
赞一下 回复此楼
3楼2017-10-08 22:04:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灯火阑珊wzm

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 青丘白浅 at 2017-10-08 22:04:10
你好楼主，请问这个问题解决了吗，目前我也面临着这个问题，另外想请教一下您知道CG-PE模型怎么构建吗，文献里一直说用蒙特卡洛方法随机生成自避行走链，但是具体构建思路我还是不大清楚，想请教一下，谢谢。

您好，请问您那找到CG-PE模型的建模方法了吗？有的话能不能分享一下，谢谢！
赞一下 回复此楼
4楼2019-03-04 09:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

灯火阑珊wzm

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 青丘白浅 at 2017-10-08 22:04:10
你好楼主，请问这个问题解决了吗，目前我也面临着这个问题，另外想请教一下您知道CG-PE模型怎么构建吗，文献里一直说用蒙特卡洛方法随机生成自避行走链，但是具体构建思路我还是不大清楚，想请教一下，谢谢。

您好，请问您那找到CG-PE模型的建模方法了吗？有的话能不能分享一下，谢谢！
赞一下 回复此楼
5楼2019-03-04 09:36:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fanofpal 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大，求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 323求调剂 +3 洼小桶 2026-03-18 3/150 2026-03-20 22:54 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 6/300 2026-03-18 22:55 by 204818@lcx
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 304求调剂 +12 小熊joy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭