| 查看: 1470 | 回复: 1 | ||
zhaozhibozhi金虫 (正式写手)
|
[求助]
使用Hmmer软件包预测细菌基因组内的转录因子结合序列
|
|
文献中发现，有人使用Hmmer包对细菌基因组内的某个转录因子的结合序列进行预测。 大概方法是：根据一批已知的转录因子结合序列，使用hmmbuild建立一个hidden Markov model，然后根据这个模型对基因组内内的匹配序列进行扫描，找到所有可能的转录因子结合序列。 我在电脑上安装了Hmmer2，根据已知的71个hrp_box序列（转录因子hrpL的结合序列）、使用hmmbuild建立了模型，然后就不知道如何开展下一步了。手头有基因组数据。恳请大神指点，不胜感激！！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
-
SW033291 科研使用解析：分子特征、储存与实验获取要点
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有207人回复
-
泛 RAS 抑制新思路：大环肽拟似物如何同时牵住突变型与野生型 RAS？
已经有0人回复
-
TYK2/JAK1 双靶点工具化合物 Brepocitinib：激酶选择性、研究进展与实验应用全解析
已经有0人回复
-
矢车菊素-3-O-葡萄糖苷质控实录：从一张HPLC图谱读懂纯度与稳定性
已经有0人回复
-
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
-
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
-
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
2楼2017-09-08 20:53:31