| 查看: 1411 | 回复: 1 | ||
zhaozhibozhi金虫 (正式写手)
|
[求助]
使用Hmmer软件包预测细菌基因组内的转录因子结合序列
|
|
文献中发现，有人使用Hmmer包对细菌基因组内的某个转录因子的结合序列进行预测。 大概方法是：根据一批已知的转录因子结合序列，使用hmmbuild建立一个hidden Markov model，然后根据这个模型对基因组内内的匹配序列进行扫描，找到所有可能的转录因子结合序列。 我在电脑上安装了Hmmer2，根据已知的71个hrp_box序列（转录因子hrpL的结合序列）、使用hmmbuild建立了模型，然后就不知道如何开展下一步了。手头有基因组数据。恳请大神指点，不胜感激！！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有295人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有3人回复
2楼2017-09-08 20:53:31
