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zzhwise金虫 (小有名气)
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【求助】在intel q6600 fedroa10 下安装并行gromacs的安装步骤
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急求在intel q6600 fedroa10 下安装并行gromacs的安装步骤！ mpich或lammpi均可以！ 目前在网上搜集的安装方法行不通！ 请高手帮忙！ [ Last edited by mingdong on 2008-12-6 at 20:07 ] |
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2楼2008-12-02 16:46:56
zzhwise
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3楼2008-12-03 12:54:23
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4楼2008-12-04 17:18:14
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5楼2008-12-04 22:46:37
zzhwise
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6楼2008-12-05 11:10:37
bay__gulf
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7楼2008-12-05 16:19:02
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mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢您！
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你是没有装FFTW，你可以下个FFTW-3的版本，安装如下： #cd fftw-3.1.2 #./configure CC=gcc CXX=g++ FC=f77 --prefix=path(你的安装路径)/fftw3 --enable-mpi --enable-float #make #make install 然后安装gromacs #cd gromacs-3.3.3 #export CPPFLAGS=-I/path(你上面安装fftw的路径)/fftw3/include #export LDFLAGS=-L/path(你上面安装fftw的路径)//fftw3/lib #./configure --prefix=/path（gromacs的安装路径）/gromacs3 --enable-mpi --without-x --with-fft=fftw3 #make #make install 你可以按上面的试试 [ Last edited by xuefei06 on 2008-12-5 at 16:33 ] |
8楼2008-12-05 16:31:58
zzhwise
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9楼2008-12-06 12:18:47
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你好 大侠 我按照你说的方法 安装FFTW没有异常 但在安装gromacs时 在make这一步出了错误 错误提示 checking dependency style of cc... gcc3 checking for mpxlc... no checking for mpicc... no checking for mpcc... no checking for hcc... no checking whether the MPI cc command works... configure: error: Cannot compile and link MPI code with cc 请大侠指点一下啊 多谢了 在线等！！！！ |
10楼2009-04-10 23:29:52