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zzhwise

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】在intel q6600 fedroa10 下安装并行gromacs的安装步骤

急求在intel q6600 fedroa10 下安装并行gromacs的安装步骤!
mpich或lammpi均可以!
目前在网上搜集的安装方法行不通!
请高手帮忙!

[ Last edited by mingdong on 2008-12-6 at 20:07 ]
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xuefei06

木虫 (正式写手)

★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢您!
引用回帖:
Originally posted by zzhwise at 2008-12-5 11:10:
我遇到的是安装lammpi时再安装gromacs说c++编译器不支持
安装mpich时gromacs安装说找不到哦fftw3f!
现在问题是,用mpich装好了groamcs,可是mdun_mpi是在 --enbale-mpi文件夹中的bin而不是在groamcs安装文件夹 ...

你是没有装FFTW,你可以下个FFTW-3的版本,安装如下:
#cd fftw-3.1.2

#./configure CC=gcc CXX=g++ FC=f77 --prefix=path(你的安装路径)/fftw3  --enable-mpi --enable-float

#make
#make install

然后安装gromacs
#cd gromacs-3.3.3
#export CPPFLAGS=-I/path(你上面安装fftw的路径)/fftw3/include
#export LDFLAGS=-L/path(你上面安装fftw的路径)//fftw3/lib

#./configure --prefix=/path(gromacs的安装路径)/gromacs3  --enable-mpi  --without-x --with-fft=fftw3
#make
#make install


你可以按上面的试试

[ Last edited by xuefei06 on 2008-12-5 at 16:33 ]
8楼2008-12-05 16:31:58
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gredream

禁虫 (正式写手)


灯塔守望者(金币+1,VIP+0):如果方便,直接解答更好。
本帖内容被屏蔽

2楼2008-12-02 16:46:56
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alwens

铁杆木虫 (正式写手)

老木虫


mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢!
这个只要吧intel fc装了
然后记住 库函数装全就可以了
万里夕阳锦背高 翻身犹恨东洋小 太公怎钓?
4楼2008-12-04 17:18:14
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xuefei06

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zzhwise at 2008-12-2 01:16:
急求在intel q6600 fedroa10 下安装并行gromacs的安装步骤!
mpich或lammpi均可以!
目前在网上搜集的安装方法行不通!
请高手帮忙!

安装GROMACS好像跟你用的系统关系不大吧,不知你遇到的问题是什么?
5楼2008-12-04 22:46:37
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