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水葫芦致病菌如何鉴定
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畏畏缩缩
新虫
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水葫芦致病菌如何鉴定
已有3人参与
我们半年内从水葫芦坏死处筛出八株菌,通过感染实验确定四株菌有致病效果,现在想深入做了解致病原理,需要把菌株鉴定出来,大神们帮帮忙!
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2016-11-10 15:39:51
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专业: 微生物学
引用回帖:
4楼
:
Originally posted by
liuchi0426
at 2016-11-12 12:48:51
先做16S(细菌)或ITS(真菌)鉴定类群,然后查下基因组有没有公布,有的话可以直接用,没有的话测de novo, 缺经费的话测草图,真菌细菌都没问题的,根据经费选三代或者二代,不缺的话多测些拼完成图再研究研究对发 ...
谢谢啦
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6楼
2017-03-22 22:50:09
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二十一业
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感谢参与,应助指数 +1
都做一下基因组草图测序就懂了,现在测序那么便宜了
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2楼
2016-11-11 09:37:54
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小冀-
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可以先测一个16S,确定一下菌株,有人做了的话就不用做了~如果没有做的,你在继续往下做呗
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···
3楼
2016-11-12 10:52:12
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liuchi0426
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先做16S(细菌)或ITS(真菌)鉴定类群,然后查下基因组有没有公布,有的话可以直接用,没有的话测de novo, 缺经费的话测草图,真菌细菌都没问题的,根据经费选三代或者二代,不缺的话多测些拼完成图再研究研究对发文章好些。然后注释基因组,找相关治病基因和代谢通路。这是普遍的研究思路。
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Iamthebest!
4楼
2016-11-12 12:48:51
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