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畏畏缩缩

新虫 (初入文坛)

[求助] 水葫芦致病菌如何鉴定 已有3人参与

我们半年内从水葫芦坏死处筛出八株菌,通过感染实验确定四株菌有致病效果,现在想深入做了解致病原理,需要把菌株鉴定出来,大神们帮帮忙!

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liuchi0426

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先做16S(细菌)或ITS(真菌)鉴定类群,然后查下基因组有没有公布,有的话可以直接用,没有的话测de novo, 缺经费的话测草图,真菌细菌都没问题的,根据经费选三代或者二代,不缺的话多测些拼完成图再研究研究对发文章好些。然后注释基因组,找相关治病基因和代谢通路。这是普遍的研究思路。
Iamthebest!
4楼2016-11-12 12:48:51
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