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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 水葫芦致病菌如何鉴定
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畏畏缩缩

新虫 (初入文坛)

[求助] 水葫芦致病菌如何鉴定 已有3人参与

我们半年内从水葫芦坏死处筛出八株菌，通过感染实验确定四株菌有致病效果，现在想深入做了解致病原理，需要把菌株鉴定出来，大神们帮帮忙！

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1楼 2016-11-10 15:39:51
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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
都做一下基因组草图测序就懂了，现在测序那么便宜了
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2楼2016-11-11 09:37:54
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以先测一个16S，确定一下菌株，有人做了的话就不用做了~如果没有做的，你在继续往下做呗
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···
3楼2016-11-12 10:52:12
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liuchi0426

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
先做16S（细菌）或ITS（真菌）鉴定类群，然后查下基因组有没有公布，有的话可以直接用，没有的话测de novo, 缺经费的话测草图，真菌细菌都没问题的，根据经费选三代或者二代，不缺的话多测些拼完成图再研究研究对发文章好些。然后注释基因组，找相关治病基因和代谢通路。这是普遍的研究思路。
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Iamthebest!
4楼2016-11-12 12:48:51
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aiyatou321

新虫 (初入文坛)
帅，把水葫芦?G了就好

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5楼2016-11-23 12:03:57
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畏畏缩缩

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuchi0426 at 2016-11-12 12:48:51
先做16S（细菌）或ITS（真菌）鉴定类群，然后查下基因组有没有公布，有的话可以直接用，没有的话测de novo, 缺经费的话测草图，真菌细菌都没问题的，根据经费选三代或者二代，不缺的话多测些拼完成图再研究研究对发 ...

谢谢啦

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6楼2017-03-22 22:50:09
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