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【求助】分子动力学建cubic cell 的问题
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The simulations in explicit water were carried out by adding to this geometry of the cyclodextrins optimized in vacuo more than one thousand of water molecules with a density to 1 g cm3 in a cubic cell with edge sizes of 33A ˚ and with periodic boundary conditions. 把我要分析的主体分子和无数水分子塞进cubic cell里，我不懂这个cubic cell是什么？怎样用MS构建？ 是不是建立一个amorphous cell？ edge sizes of 33A ˚是啥意思？ 还有我做单个分子的动力学discover，做完了，文档被锁住了，不能操作，不知道为什么？已经多次发生这种问题了。操作的时候鼠标旁边有一个小锁。、 请高手帮我解决一下好吗？ 谢谢。 [ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 13:49 ] |
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