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dolphin100

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】紧急求助

修回稿中审稿人让计算蛋白质的native contact number?什么软件可以做啊
本人做了个MD实验,有轨迹文件, 用什么软件计算得到?如何计算? VMD,insightII??......
由于稿子需要快速回复, 着急等待高手赐教!
不胜感激!

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-10 at 15:06 ]
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Constanteffortscanyieldsuresuccess!
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dolphin100

木虫 (正式写手)

呵呵,就是蛋白质中骨架上的C-alpha原子的自然接触数,审稿人让计算的,
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
7楼2008-11-29 17:23:27
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查看全部 14 个回答

yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
不大懂你的意思。如果计算MD的话,MS的discover,以及insightII的discover可以做。
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
2楼2008-11-28 08:45:09
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dolphin100

木虫 (正式写手)

insightII里哪里可以计算nativie contacts
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
3楼2008-11-28 20:00:49
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dolphin100

木虫 (正式写手)

我目前有分子动力学模拟完后的轨迹文件,文件里有10000个构象,我想计算这10000个构象你的自然接触情况.大家觉得该用什么软件计算
Constanteffortscanyieldsuresuccess!
4楼2008-11-28 20:01:54
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