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记忆的拾荒者

新虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
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性别: GG
专业: 化工热力学和基础数据

[求助] 关于lammps的fix命令已有1人参与

想请问各位大神，对于fix固定键长键角，手册中说小的集团水分子甲基亚甲基可以固定如果是长链的烷烃碳碳键连接就不能，那应该采取什么方法呢？

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1楼 2016-10-19 15:31:55

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gredream

禁虫 (正式写手)

感谢参与，应助指数 +1

本帖内容被屏蔽

2楼2016-10-19 19:09:22

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

龙也乐逍遥

金虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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专业: 能源化工

引用回帖:

2楼: Originally posted by gredream at 2016-10-19 19:09:22
这个叫键角约束；常用的方法是Lincs算法，而LAMMPS似乎不支持这个，LAMMPS支持的shake 或rattle方法，好像只对小分子比较好用。

如果你要模拟刚体，可以用fix rigid；否则，只能用很大的键角势进行约束了。

我在文献中看到基本上都是固定键长，键长系数都没有，键角会有系数，不用固定那在您看来我应该怎么解决呢

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3楼2016-11-30 10:18:52

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