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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于lammps的fix命令
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记忆的拾荒者

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于lammps的fix命令 已有1人参与

想请问各位大神，对于fix固定键长键角，手册中说小的集团水分子 甲基亚甲基可以固定 如果是长链的烷烃碳碳键连接就不能，那应该采取什么方法呢？
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1楼 2016-10-19 15:31:55
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龙也乐逍遥

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gredream at 2016-10-19 19:09:22
这个叫键角约束；常用的方法是Lincs算法，而LAMMPS似乎不支持这个，LAMMPS支持的shake 或rattle方法，好像只对小分子比较好用。

如果你要模拟刚体，可以用fix rigid；否则，只能用很大的键角势进行约束了。

我在文献中看到基本上都是固定键长，键长系数都没有，键角会有系数，不用固定 那在您看来 我应该怎么解决呢
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3楼2016-11-30 10:18:52
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gredream

禁虫 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
2楼2016-10-19 19:09:22
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