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记忆的拾荒者

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于lammps的fix命令 已有1人参与

想请问各位大神,对于fix固定键长键角,手册中说小的集团水分子 甲基亚甲基可以固定 如果是长链的烷烃碳碳键连接就不能,那应该采取什么方法呢?
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gredream

禁虫 (正式写手)

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2楼2016-10-19 19:09:22
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龙也乐逍遥

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gredream at 2016-10-19 19:09:22
这个叫键角约束;常用的方法是Lincs算法,而LAMMPS似乎不支持这个,LAMMPS支持的shake 或rattle方法,好像只对小分子比较好用。

如果你要模拟刚体,可以用fix rigid;否则,只能用很大的键角势进行约束了。

我在文献中看到基本上都是固定键长,键长系数都没有,键角会有系数,不用固定 那在您看来 我应该怎么解决呢
3楼2016-11-30 10:18:52
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