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messi雄霸

新虫 (小有名气)

[求助] 请问在算吸附能的时候,被吸附分子与吸附吸附剂的吸附平衡距离是怎么算出来的? 已有1人参与

本人刚接触MS, 想用Dmol3计算结合能,可是不知道被吸附分子与吸附剂的距离应该怎么设置?求大神指点迷津
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messi雄霸

新虫 (小有名气)

2楼2016-10-05 22:33:23
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messi雄霸

新虫 (小有名气)

再顶一下,哈哈
3楼2016-10-05 22:33:37
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
蛋蛋小童鞋: 金币+1, 谢谢 2016-10-07 21:43:19
大致设置一个距离即可,之后优化得出更精确的距离
4楼2016-10-05 22:51:47
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messi雄霸

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-10-05 22:51:47
大致设置一个距离即可,之后优化得出更精确的距离

软件自己会优化好么?

发自小木虫Android客户端
5楼2016-10-05 23:40:36
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wangchenchao

新虫 (小有名气)

可能是当能量变化,位移等收敛到某个值,这些值跟选择的精度有关,精度越高,算的越慢,但结果越可靠,其实我也不是很懂。

发自小木虫Android客户端
6楼2016-10-07 21:38:09
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有何不可琼

银虫 (著名写手)

★ ★
messi雄霸(蛋蛋小童鞋代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-10-08 10:19:14
一般,我们会参考一个文献中的经验值,建好模型,然后用vasp作结构优化,会得到一个稳定结构。没有经验值的话,就直接建模,结构优化的时候,最后精确一些。

发自小木虫Android客户端
优秀的研究员是自己学出来的
7楼2016-10-08 08:47:32
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messi雄霸

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 有何不可琼 at 2016-10-08 08:47:32
一般,我们会参考一个文献中的经验值,建好模型,然后用vasp作结构优化,会得到一个稳定结构。没有经验值的话,就直接建模,结构优化的时候,最后精确一些。

是不是先选一个大概距离,自己再慢慢改?

发自小木虫Android客户端
8楼2016-10-08 09:00:36
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有何不可琼

银虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by messi雄霸 at 2016-10-08 09:00:36
是不是先选一个大概距离,自己再慢慢改?
...

可以的,先建好一个大致的模型,然后优化结构,让它自己驰豫,达到一个稳定状态。

发自小木虫Android客户端
优秀的研究员是自己学出来的
9楼2016-10-08 09:03:07
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messi雄霸

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 有何不可琼 at 2016-10-08 09:03:07
可以的,先建好一个大致的模型,然后优化结构,让它自己驰豫,达到一个稳定状态。
...

是这样吗?
请问在算吸附能的时候,被吸附分子与吸附吸附剂的吸附平衡距离是怎么算出来的?



发自小木虫Android客户端
10楼2016-10-08 10:10:44
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