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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » sybyl做QSAR怎么录入活性数据
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zhongyifan

金虫 (正式写手)

[求助] sybyl做QSAR怎么录入活性数据 已有2人参与

我要录入的是MIC值。我先用ChemDraw画了分子保存为sdf格式，在sybyl里QSAR里打开，每个分子都列出来了，但是不知道怎么添加活性也就是MIC这一栏？MIC值是不是要转成PMIC？翻了好多教程都是直接导入的做好了的数据，没有说怎么录入的

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1楼 2016-10-02 00:47:50
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

时光和旅人

新虫 (正式写手)
做成text格式导入的。我也在学这个，有空可以交流。

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4楼2016-10-06 00:33:43
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...牛皮糖

新虫 (小有名气)
PMC值是你自己预先算好的，之后在游记分子表单，Add Column,   增加PMC50，选择number
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加油
10楼2016-11-15 16:01:44
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普通回帖

zhongyifan

金虫 (正式写手)
2楼2016-10-02 10:50:01
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JIANGWENJUN

新虫 (正式写手)
这个我给忘了，尴尬

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3楼2016-10-03 20:10:49
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Erick123

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
5楼2016-10-06 09:52:38
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zhongyifan

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 时光和旅人 at 2016-10-06 00:33:43
做成text格式导入的。我也在学这个，有空可以交流。

哦，我自己摸出来了，我用SDF格式导入结构式，Excel里的CSV格式导入活性数据。可是确定模板分子时发现不是mdb格式，而那个只认mdb格式，求解
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6楼2016-10-06 14:40:52
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zhongyifan

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Erick123 at 2016-10-06 09:52:38
我也不会这个，求帮助

可用Excal把活性做成表格，保存为CSV格式，可直接导入sybyl
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7楼2016-10-06 14:41:46
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Erick123

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
8楼2016-10-06 23:40:25
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FMStation

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

http://www.bbioo.com/experiment/105-179322-1.html
SYBYL--molecular spreadsheet（表格）里数据的输入

http://wenku.baidu.com/view/898b5c4f2e3f5727a5e962c5.html###
SYBYL详细讲义

http://www.tri-ibiotech.com.cn/Video/
培训

https://www.youtube.com/watch?v=-Z3pgrsVQ2s
SYBYL-X - How to use the QSAR Project Manager

https://www.youtube.com/watch?v=4NYZVQeKzEI
QSAR Part A

https://www.youtube.com/watch?v=BVCJuavKBnE
QSAR Part B
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9楼2016-10-09 18:55:32
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