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宅2014

新虫 (初入文坛)

[求助] 高岭石如何修改poscar使晶胞能变成超胞千金散尽!!事后重谢!!! 已有3人参与

虫友们,最近做vasp计算高岭石,遇到问题了实在解决不了,特来求救~~
以前我是计算的高岭石加压的,模型我有,现在我想计算高岭石吸水,要建一个2×2×1的超胞。这个超胞建好后还应有真空层,但我该怎么做呢?高岭石的晶胞模型(vasp计算用的POSCAR)我有,我会附在附件上。那问题是,我想实现这个目的,如果直接对基失和基失坐标进行修改,我该怎么修改POSCAR呢才能变成2×2×1的超胞?
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蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
宅2014(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-30 22:59:47
把a,b,c扩大4倍,原子数也扩大四倍,但是下面的分数坐标也得改吧,所以我觉得还是用ms好。。。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

愿不负最苦的时光
3楼2016-09-30 00:24:49
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普通回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
宅2014(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-30 22:59:34
phonopy可以做到

发自小木虫Android客户端
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
2楼2016-09-29 23:10:28
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

用ms转换下吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-09-30 07:38:05
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
VESTA,MS等等各种各样的软件,都能实现。欢迎到提问,会有专人解答
5楼2016-09-30 08:51:43
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starrywang

新虫 (正式写手)

ms弹弹手指,vasp连手指都不会弹

发自小木虫Android客户端
6楼2016-10-02 08:49:11
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宅2014

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by magicmonk at 2016-09-29 23:10:28
phonopy可以做到

phonopy具体怎么实现呢,这个软件我没用过,好不好实现?
7楼2016-10-02 18:01:17
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
很多软件都可以啊。phonopy,ms,vaspkit
8楼2016-10-02 19:43:24
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宅2014

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-09-30 00:24:49
把a,b,c扩大4倍,原子数也扩大四倍,但是下面的分数坐标也得改吧,所以我觉得还是用ms好。。。

谢谢,您的回复,是的,如果建模的话好像MS会好些,但我没用过,我弄得了一个2×2×1的超晶胞(也是poscar),现在试着将POSCAR导入MS中,但之后该怎么加真空层呢?我想在Z方向上加上10埃左右。或者不在MS上能实现吗?我不太懂MS,如果一定要在MS上弄,具体怎么做呢,希望详细一点。万分感谢!!
9楼2016-10-02 19:59:46
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宅2014

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-09-30 00:24:49
把a,b,c扩大4倍,原子数也扩大四倍,但是下面的分数坐标也得改吧,所以我觉得还是用ms好。。。

谢谢您的回复,但是我还有一个问题,我现在已经得到了一个2×2×1的超胞了(但还是POSCAR的形式),那我想在这个超胞Z方向上加上真空层,那我该如何操作呢?我想是不是可以将POSCAR导入到MS中(应为MS上建的模型可以到处POSCAR,所以感觉可以反着导回到MS中吧?),然后再加真空层,那该怎么操作呢?不知道您您可不可以不厌其烦的详细说明怎么操作呢,加真空层10埃左右。谢谢!!!
10楼2016-10-02 20:07:46
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