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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 高岭石如何修改poscar使晶胞能变成超胞千金散尽！！事后重谢！！！
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宅2014

新虫 (初入文坛)

[求助] 高岭石如何修改poscar使晶胞能变成超胞千金散尽！！事后重谢！！！ 已有3人参与

虫友们，最近做vasp计算高岭石，遇到问题了实在解决不了，特来求救~~
以前我是计算的高岭石加压的，模型我有，现在我想计算高岭石吸水，要建一个2×2×1的超胞。这个超胞建好后还应有真空层，但我该怎么做呢？高岭石的晶胞模型（vasp计算用的POSCAR）我有，我会附在附件上。那问题是，我想实现这个目的，如果直接对基失和基失坐标进行修改，我该怎么修改POSCAR呢才能变成2×2×1的超胞？
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1楼 2016-09-29 22:25:54
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
宅2014(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-30 22:59:47
把a，b，c扩大4倍，原子数也扩大四倍，但是下面的分数坐标也得改吧，所以我觉得还是用ms好。。。
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宅2014
愿不负最苦的时光
3楼2016-09-30 00:24:49
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普通回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
宅2014(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-30 22:59:34
phonopy可以做到

发自小木虫Android客户端
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我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
2楼2016-09-29 23:10:28
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)
用ms转换下吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2016-09-30 07:38:05
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
VESTA,MS等等各种各样的软件，都能实现。欢迎到提问，会有专人解答
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5楼2016-09-30 08:51:43
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starrywang

新虫 (正式写手)
ms弹弹手指，vasp连手指都不会弹

发自小木虫Android客户端
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6楼2016-10-02 08:49:11
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宅2014

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by magicmonk at 2016-09-29 23:10:28
phonopy可以做到

phonopy具体怎么实现呢，这个软件我没用过，好不好实现？
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7楼2016-10-02 18:01:17
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小虫虫LG

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
很多软件都可以啊。phonopy，ms，vaspkit
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8楼2016-10-02 19:43:24
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宅2014

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-09-30 00:24:49
把a，b，c扩大4倍，原子数也扩大四倍，但是下面的分数坐标也得改吧，所以我觉得还是用ms好。。。

谢谢，您的回复，是的，如果建模的话好像MS会好些，但我没用过，我弄得了一个2×2×1的超晶胞（也是poscar）,现在试着将POSCAR导入MS中，但之后该怎么加真空层呢？我想在Z方向上加上10埃左右。或者不在MS上能实现吗？我不太懂MS，如果一定要在MS上弄，具体怎么做呢，希望详细一点。万分感谢！！
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9楼2016-10-02 19:59:46
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宅2014

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-09-30 00:24:49
把a，b，c扩大4倍，原子数也扩大四倍，但是下面的分数坐标也得改吧，所以我觉得还是用ms好。。。

谢谢您的回复，但是我还有一个问题，我现在已经得到了一个2×2×1的超胞了（但还是POSCAR的形式），那我想在这个超胞Z方向上加上真空层，那我该如何操作呢？我想是不是可以将POSCAR导入到MS中（应为MS上建的模型可以到处POSCAR,所以感觉可以反着导回到MS中吧？），然后再加真空层，那该怎么操作呢？不知道您您可不可以不厌其烦的详细说明怎么操作呢，加真空层10埃左右。谢谢！！！
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10楼2016-10-02 20:07:46
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