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宅2014

新虫 (初入文坛)

[求助] 高岭石如何修改poscar使晶胞能变成超胞千金散尽!!事后重谢!!! 已有3人参与

虫友们,最近做vasp计算高岭石,遇到问题了实在解决不了,特来求救~~
以前我是计算的高岭石加压的,模型我有,现在我想计算高岭石吸水,要建一个2×2×1的超胞。这个超胞建好后还应有真空层,但我该怎么做呢?高岭石的晶胞模型(vasp计算用的POSCAR)我有,我会附在附件上。那问题是,我想实现这个目的,如果直接对基失和基失坐标进行修改,我该怎么修改POSCAR呢才能变成2×2×1的超胞?
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金虫 (正式写手)

楼主,你有poscar,把它直接推进vesta另存为后缀名cif格式,拖进ms找build菜单,里面可以实现你要的。然后保存,再到相应文件夹下找到cif拖进vesta另存为poscar就可以了。或者直接修改poscar这样就要用matlab去一个一个原子z轴算坐标,x y只需要copy就好,好好研究poscar的原子排放规律。结构随意做出来

发自小木虫Android客户端
14楼2016-10-03 19:26:54
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
宅2014(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-30 22:59:34
phonopy可以做到

发自小木虫Android客户端
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
2楼2016-09-29 23:10:28
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蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
宅2014(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-30 22:59:47
把a,b,c扩大4倍,原子数也扩大四倍,但是下面的分数坐标也得改吧,所以我觉得还是用ms好。。。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

愿不负最苦的时光
3楼2016-09-30 00:24:49
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

用ms转换下吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-09-30 07:38:05
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