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急求gaussian输入文件内坐标写法,60金币大奖
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myworldj
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急求gaussian输入文件内坐标写法,60金币大奖
如图所示,当我用gaussianview构建分子并保存为内坐标形式时软件会自动定义变量,但是为了对某个键长(例如在这里是C1和C4)进行刚性扫描,需要定义的变量里有这个C1和C4的长度变量,但显然自动保存的内坐标中没有这个变量,自问如何操作用另一套内坐标表示分子,使其包括C1和C4长度的变量。尽管手动写入可以,但对于我要构建的大分子手动写入实在太麻烦,请提供一个自动转变的方法,谢谢
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5楼
:
Originally posted by
极乐禅宗
at 2016-09-29 12:28:37
b, a, d 分别是健长,健角和二面角
问题是如果自己添加变量就可能造成扫描变量与其他变量相关,这样就不是刚性扫描了啊
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7楼
2016-09-29 20:07:21
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极乐禅宗
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要扫描的健长没有必要非得出现在内坐标中,直接指定就好了
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2楼
2016-09-28 11:54:20
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2楼
:
Originally posted by
极乐禅宗
at 2016-09-28 11:54:20
要扫描的健长没有必要非得出现在内坐标中,直接指定就好了
柔性扫描可以不用制指定,这个我知道,但做刚性扫描不行啊,要扫描的参数必须出现在坐标定义中
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3楼
2016-09-29 11:46:33
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试试这样行不行,第四行改成: c 1 b 2 a 3 d
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4楼
2016-09-29 12:27:31
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