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【求助】新手请教分子模拟问题 已有5人参与
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我想做氨基酸或多肽在方解石表面的动力学模拟，用哪个软件比较好？ 我只知道人家有用Material Studio做模拟的。 还有个问题是：蒙特卡罗模拟到底是用什么软件？是自己编程的吗？ 谢谢指点！ [ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 14:19 ] |
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dellus
木虫 (职业作家)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-03-24 13:00:51
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MC模拟的实际是体系的pratition function，不同的configuration之间没有时间联系，如果硬要把configuration间建立时间顺序则会出现问题。假设我用不同的trial move方法，例如repation和pivot，两者效率不同，得到的autocorrelation time也不同，这样的话，哪个autocorrelation time能对应真实时间体系？ 不过牛人也写过用MC做dynamic的文章，Kurt Kremer 1988年在大分子上的The bond fluctuation method。另外，Kremer拿了今年的Polymer Physics Prize。 |
21楼2011-03-24 05:41:13
fansw1129
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