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Phil宏爷

新虫 (初入文坛)

[求助] MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用 已有3人参与

请教一下大家,我用autodock做了小分子和蛋白质的对接,然后用moe软件分析对接的结果,分析蛋白质与配体小分子相互作用,2D图如图1,图中紫色,蓝色,绿色虚线分别表示什么意思呢?氢键?
如果改成3D(图2)模式查看的话,发现和2D图不一样,请问又是什么原因?

MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用
图1.jpg


MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用-1
图2.png
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Phil宏爷

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by pymol at 2016-09-26 15:16:23
autodock 怎么显示这么分辨率的图?show interaction然后呢?...

导出,可以选择图片格式和分辨率
9楼2016-09-29 10:45:35
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zwc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
2D 图是在ligand interaction窗口里面看到的吧,该窗口下面部分有legend,会详细告诉你各个符号代表的含义。
CHEM-IS-TRY
2楼2016-09-20 18:46:22
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Phil宏爷

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zwc at 2016-09-20 18:46:22
2D 图是在ligand interaction窗口里面看到的吧,该窗口下面部分有legend,会详细告诉你各个符号代表的含义。

对,是在ligand interaction窗口里面看到的。下面虽然有说定义,但没说是什么作用,紫色虚线说是metal contact
3楼2016-09-20 20:00:50
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
图2是用autodock做的图?
4楼2016-09-21 14:40:52
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