应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用
51/1返回列表
查看: 5539  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Phil宏爷

新虫 (初入文坛)

[求助] MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用 已有3人参与

请教一下大家，我用autodock做了小分子和蛋白质的对接，然后用moe软件分析对接的结果，分析蛋白质与配体小分子相互作用，2D图如图1，图中紫色，蓝色，绿色虚线分别表示什么意思呢？氢键？
如果改成3D（图2）模式查看的话，发现和2D图不一样，请问又是什么原因？

MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用
图1.jpg


MOE软件分析蛋白质与配体小分子相互作用-1
图2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-09-20 16:41:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
引用回帖:
6楼: Originally posted by Phil宏爷 at 2016-09-26 12:40:16
是的

autodock 怎么显示这么分辨率的图？show interaction然后呢？
赞一下 回复此楼
8楼2016-09-26 15:16:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

zwc

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
2D 图是在ligand interaction窗口里面看到的吧，该窗口下面部分有legend，会详细告诉你各个符号代表的含义。
赞一下(1人) 回复此楼
CHEM-IS-TRY
2楼2016-09-20 18:46:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Phil宏爷

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zwc at 2016-09-20 18:46:22
2D 图是在ligand interaction窗口里面看到的吧，该窗口下面部分有legend，会详细告诉你各个符号代表的含义。

对，是在ligand interaction窗口里面看到的。下面虽然有说定义，但没说是什么作用，紫色虚线说是metal contact
赞一下 回复此楼
3楼2016-09-20 20:00:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
图2是用autodock做的图？
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2016-09-21 14:40:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭