应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » materials studio安装与作业调度
71/1返回列表
查看: 1552  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

gyoyo

新虫 (正式写手)

[求助] materials studio安装与作业调度 已有2人参与

想请教大家一个问题，我在集群上安装了MS，但是不会写作业调度的脚本。我现在有一个该集群上vasp的pbs提交作业脚本，我想能不能通过简单修改这个pbs来给MS提交作业用呢？
#!/bin/bash

#

##PBS -q sixteen

#PBS -l nodes=1:ppn=16

#PBS -l walltime=240:00:00

#PBS -j oe

#PBS -V



# go to work dir

cd $PBS_O_WORKDIR



# The program we want to execute

export  EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12



export  NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

export  N_MPD=`cat $PBS_NODEFILE|uniq|wc -l`



# Intel MPI Home

MPI_HOME=/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64



$MPI_HOME/bin/mpdcleanup -r ssh -f $PBS_NODEFILE

$MPI_HOME/bin/mpdboot -r ssh -n $N_MPD -f $PBS_NODEFILE



# running program

$MPI_HOME/bin/mpiexec -genv I_MPI_DEBUG 3 -n $NP $EXEC
#vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60


# clean mpd daemon

$MPI_HOME/bin/mpdallexit

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-09-19 23:33:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyoyo

新虫 (正式写手)
如果可以的话，请问怎么改？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2016-09-19 23:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyoyo(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-20 09:26:36
可以，看你需要调用哪个模块，就调哪个模块就行。具体以自己的安装路径为准
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2016-09-20 08:43:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyoyo

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-09-20 08:43:12
可以，看你需要调用哪个模块，就调哪个模块就行。具体以自己的安装路径为准

我想调用castep模块，是不是把export  EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12这行改成castep模块的目录？我这样改过，可是作业还是交不上去。还有倒数第三行#vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60是什么意思，该怎么改?
赞一下 回复此楼
4楼2016-09-20 15:29:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
可以到直答理工网我的vasp讨论组来发帖，我帮改

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2016-09-20 15:57:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szp12345

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
参考中科大《Materials Studio软件的安装与并行计算使用手册》，直接用命令调用相应的模块就可以了

这个手册网上很好找的
http://www.docin.com/p-1326023646.html
赞一下 回复此楼
6楼2016-09-21 14:42:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guazifeng

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-09-20 15:57:32
可以到直答理工网我的vasp讨论组来发帖，我帮改

直答理工无处不在

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-09-23 00:10:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gyoyo 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 8rmuugja8q 2026-02-22 8/400 2026-02-23 12:22 by alian_214
[基金申请] 体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层，如同你们一样大部分普通教师忙且收入低 +10 瞬息宇宙 2026-02-20 13/650 2026-02-23 11:23 by holypower
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 khieu8v8m0 2026-02-22 8/400 2026-02-23 09:35 by w4l55oybr1
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +5 usprnugpzw 2026-02-21 11/550 2026-02-23 09:24 by w4l55oybr1
[教师之家] 为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊，但还是做不出宇树机器人？ +5 欢乐颂叶蓁 2026-02-21 8/400 2026-02-23 09:19 by 欢乐颂叶蓁
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 w89i99eaeh 2026-02-22 5/250 2026-02-23 08:04 by w4l55oybr1
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 khieu8v8m0 2026-02-22 6/300 2026-02-23 07:59 by w4l55oybr1
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +6 3dfhjxgsh7 2026-02-22 9/450 2026-02-23 07:49 by w4l55oybr1
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 khieu8v8m0 2026-02-22 4/200 2026-02-23 06:46 by jsjzfl
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 khieu8v8m0 2026-02-22 5/250 2026-02-23 06:29 by w4l55oybr1
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 khieu8v8m0 2026-02-22 8/400 2026-02-23 06:24 by w4l55oybr1
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +5 3dfhjxgsh7 2026-02-22 6/300 2026-02-23 02:04 by 5jlh3qtdvx
[教师之家] 版面费该交吗 +7 苹果在哪里 2026-02-22 8/400 2026-02-22 22:37 by otani
[基金申请] 面上可以超过30页吧？ +4 阿拉贡aragon 2026-02-22 4/200 2026-02-22 21:22 by 山西悬空寺空悬�
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 usprnugpzw 2026-02-21 6/300 2026-02-22 19:48 by w89i99eaeh
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 3dfhjxgsh7 2026-02-22 4/200 2026-02-22 16:52 by khieu8v8m0
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 usprnugpzw 2026-02-22 3/150 2026-02-22 16:37 by khieu8v8m0
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 usprnugpzw 2026-02-21 4/200 2026-02-22 16:27 by khieu8v8m0
[基金申请] “人文社科而论，许多学术研究还没有达到民国时期的水平” +4 苏东坡二世 2026-02-18 5/250 2026-02-22 16:07 by liangep1573
[基金申请] 今年春晚有几个节目很不错，点赞！ +11 瞬息宇宙 2026-02-16 12/600 2026-02-21 21:14 by lq493392203
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭