应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » materials studio安装与作业调度
71/1返回列表
查看: 1669  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

gyoyo

新虫 (正式写手)

[求助] materials studio安装与作业调度 已有2人参与

想请教大家一个问题，我在集群上安装了MS，但是不会写作业调度的脚本。我现在有一个该集群上vasp的pbs提交作业脚本，我想能不能通过简单修改这个pbs来给MS提交作业用呢？
#!/bin/bash

#

##PBS -q sixteen

#PBS -l nodes=1:ppn=16

#PBS -l walltime=240:00:00

#PBS -j oe

#PBS -V



# go to work dir

cd $PBS_O_WORKDIR



# The program we want to execute

export  EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12



export  NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

export  N_MPD=`cat $PBS_NODEFILE|uniq|wc -l`



# Intel MPI Home

MPI_HOME=/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64



$MPI_HOME/bin/mpdcleanup -r ssh -f $PBS_NODEFILE

$MPI_HOME/bin/mpdboot -r ssh -n $N_MPD -f $PBS_NODEFILE



# running program

$MPI_HOME/bin/mpiexec -genv I_MPI_DEBUG 3 -n $NP $EXEC
#vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60


# clean mpd daemon

$MPI_HOME/bin/mpdallexit

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-09-19 23:33:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyoyo

新虫 (正式写手)
如果可以的话，请问怎么改？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2016-09-19 23:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyoyo(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-20 09:26:36
可以，看你需要调用哪个模块，就调哪个模块就行。具体以自己的安装路径为准
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2016-09-20 08:43:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyoyo

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-09-20 08:43:12
可以，看你需要调用哪个模块，就调哪个模块就行。具体以自己的安装路径为准

我想调用castep模块，是不是把export  EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12这行改成castep模块的目录？我这样改过，可是作业还是交不上去。还有倒数第三行#vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60是什么意思，该怎么改?
赞一下 回复此楼
4楼2016-09-20 15:29:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
可以到直答理工网我的vasp讨论组来发帖，我帮改

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2016-09-20 15:57:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szp12345

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
参考中科大《Materials Studio软件的安装与并行计算使用手册》，直接用命令调用相应的模块就可以了

这个手册网上很好找的
http://www.docin.com/p-1326023646.html
赞一下 回复此楼
6楼2016-09-21 14:42:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guazifeng

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-09-20 15:57:32
可以到直答理工网我的vasp讨论组来发帖，我帮改

直答理工无处不在

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-09-23 00:10:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gyoyo 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +3 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-08 12:22 by 仁砚薪传
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] fileCode有新解读？ +8 Tide man 2026-08-08 16/800 2026-08-08 09:59 by Tide man
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭