应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » materials studio安装与作业调度
71/1返回列表
查看: 1681  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

gyoyo

新虫 (正式写手)

[求助] materials studio安装与作业调度 已有2人参与

想请教大家一个问题，我在集群上安装了MS，但是不会写作业调度的脚本。我现在有一个该集群上vasp的pbs提交作业脚本，我想能不能通过简单修改这个pbs来给MS提交作业用呢？
#!/bin/bash

#

##PBS -q sixteen

#PBS -l nodes=1:ppn=16

#PBS -l walltime=240:00:00

#PBS -j oe

#PBS -V



# go to work dir

cd $PBS_O_WORKDIR



# The program we want to execute

export  EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12



export  NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

export  N_MPD=`cat $PBS_NODEFILE|uniq|wc -l`



# Intel MPI Home

MPI_HOME=/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64



$MPI_HOME/bin/mpdcleanup -r ssh -f $PBS_NODEFILE

$MPI_HOME/bin/mpdboot -r ssh -n $N_MPD -f $PBS_NODEFILE



# running program

$MPI_HOME/bin/mpiexec -genv I_MPI_DEBUG 3 -n $NP $EXEC
#vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60


# clean mpd daemon

$MPI_HOME/bin/mpdallexit

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-09-19 23:33:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyoyo

新虫 (正式写手)
如果可以的话，请问怎么改？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2016-09-19 23:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyoyo(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-09-20 09:26:36
可以，看你需要调用哪个模块，就调哪个模块就行。具体以自己的安装路径为准
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2016-09-20 08:43:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyoyo

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-09-20 08:43:12
可以，看你需要调用哪个模块，就调哪个模块就行。具体以自己的安装路径为准

我想调用castep模块，是不是把export  EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12这行改成castep模块的目录？我这样改过，可是作业还是交不上去。还有倒数第三行#vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60是什么意思，该怎么改?
赞一下 回复此楼
4楼2016-09-20 15:29:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
可以到直答理工网我的vasp讨论组来发帖，我帮改

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2016-09-20 15:57:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szp12345

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
参考中科大《Materials Studio软件的安装与并行计算使用手册》，直接用命令调用相应的模块就可以了

这个手册网上很好找的
http://www.docin.com/p-1326023646.html
赞一下 回复此楼
6楼2016-09-21 14:42:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guazifeng

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-09-20 15:57:32
可以到直答理工网我的vasp讨论组来发帖，我帮改

直答理工无处不在

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-09-23 00:10:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gyoyo 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +31 医学老男孩 2026-08-13 69/3450 2026-08-16 00:16 by mo_mo_mo_mo
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +9 majunge000 2026-08-11 11/550 2026-08-15 23:20 by botar
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭