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vasp001金虫 (正式写手)
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【求助】安装Materials Studio 总是提示JRE 环境找不到,
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安装Materials Studio 总是提示JRE 环境找不到,请问如何解决? Last login: Wed Sep 15 21:03:11 2010 from 202.38.88.229 联想公司赠送的深腾1800高性能机已基本安装调试完毕,开始试运行。 该机有64台计算节点,每个计算节点为双Intel E5410 CPU,4G内存,通过千兆以太网互 联,峰值计算能力4.77TFLOPS。 操作系统为CentOS 5.2,安装有gcc 4.1.2, icc 10.1,i fort 10.1等编译软件,Intel MKL库等。 安装的软件主要在目录/opt下,相关的文档也在里面。 使用方式与原有HP RX2600 集群基本相同。机器中开了2个作业调度队列,分别是normal 和mpi队列。normal队列限制一个作业最多占用8个CPU,并限制在一台机器中运行, 这样做是为了减少跨机器的通信以提高效率。mpi队列限制一个作业最多占用64个 CPU,可以运行稍微大一些的MPI作业。 提交作业例子: 1. 提交一个占用8 CPU的./cpi例子作业 bsub -n 8 -o cpi_8.out -e cpi_8.err mpijob ./cpi 2. 提交一个占用64 CPU的./cpi例子作业 bsub -q mpi -n 64 -o cpi_64.out -e cpi_64.err mpijob ./cpi 3. 提交一个占用8 CPU的openMP作业 bsub -a openmp -n 8 -o job.o -e job.e ./openmp_prog 注意: 现在所有机器共享一个磁盘阵列,所以I/O的性能很低(所有节点I/O带宽1G),如果运 算中需要用到临时文件,可以使用各个节点的/local目录(每个节点I/O带宽接近1G, 这个目录各个节点独立,不共享)。 更新: 1. 安装了Python2.5,在/opt/Python2.5下 2. 主节点上每用户最多允许500个进程,占用1G内存 3. 修改成每个用户最多占用128处理器 (2008.11.04 以前为200) Notice: Serial jobs ,please to use the " serial " queue : -q serial |
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