应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 如何从基因或蛋白层面表征微生物的繁殖速率快？活性高？
141/2返回列表12下一页
查看: 1740  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wuyundang

捐助贵宾 (小有名气)

[求助] 如何从基因或蛋白层面表征微生物的繁殖速率快？活性高？ 已有1人参与

求问
我有两个处理，纯菌，其中一个处理的微生物生长更快、繁殖更快。
我想从蛋白或者分子生物学层面给一个测试结果，说明确实生理活性很高繁殖得快。

应该测什么东西呢？比如测基因表达，应该测什么基因的表达？代谢相关的吗？代谢相关的是什么基因……？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2016-09-09 08:52:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

kuaile5420

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wuyundang at 2016-09-09 09:48:15
做了RNA-seq，但是不是很明白哪个基因才与它的生长繁殖有关。
整个转录组数据中，显著上调的基因数并不多，只有不到一百个，通过KEGG分析，没有看到那条通路有明显的上调（主要是上调的基因数少）。所以我想先找到 ...

这个通过文献调研，基因不到100个，都查一下时间也不会很久的，在NCBI中都查下，自己再选出其中与繁殖（增值）相关的基因，可能到最后也不会很多的。还有就是上调和下调都有可能影响繁殖的。你也可以查一部分，比如查够5个基因，自己再走下定量验证下是不是和RNA-seq结果一致，确定了研究目标后，再往下做。
赞一下(1人) 回复此楼
坚持到底就是胜利！
4楼2016-09-09 09:57:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖提问 2016-09-09 09:09:47
wuyundang: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢 2016-09-09 10:48:21
你可以查下你（其他）细菌的相关文献，看看有没有具体的基因参与生长调控的，然后做下这个基因的RT-qPCR看看该基因是否变化。当然，如果有钱的话，可以收集处理和不处理的细菌的total RNA，做个RNA-seq，挑选出其中的差异基因，再进行文献调研，确定你要研究的基因。
赞一下 回复此楼
坚持到底就是胜利！
2楼2016-09-09 09:06:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyundang

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by kuaile5420 at 2016-09-09 09:06:38
你可以查下你（其他）细菌的相关文献，看看有没有具体的基因参与生长调控的，然后做下这个基因的RT-qPCR看看该基因是否变化。当然，如果有钱的话，可以收集处理和不处理的细菌的total RNA，做个RNA-seq，挑选出其中 ...

做了RNA-seq，但是不是很明白哪个基因才与它的生长繁殖有关。
整个转录组数据中，显著上调的基因数并不多，只有不到一百个，通过KEGG分析，没有看到那条通路有明显的上调（主要是上调的基因数少）。所以我想先找到与它“繁殖”速率相关的基因。
赞一下 回复此楼
3楼2016-09-09 09:48:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyundang

捐助贵宾 (小有名气)
内容已删除
回复此楼
5楼2016-09-09 10:14:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-09-10 22:36:22
在NCBI种查询基因功能有两种办法：一个是直接在pubmed进行文献搜索，输入这个基因名称+细菌，或者直接输入该基因名称，进入摘要，看是否与增值（繁殖）有关系，如果有的话没就算找到一个基因；另外一种就是在NCBI的gene数据库中输入该基因，在检索界面选择相应物种，查看该基因功能。
赞一下 回复此楼
坚持到底就是胜利！
6楼2016-09-09 13:17:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyfskj

新虫 (著名写手)
请问你菌的生长更快是跟指它通过一些改造以后跟原始菌相比还是？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
向我乞求怜悯吧，我会狠狠拒绝的。
7楼2016-09-10 14:49:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shanyue00

铁杆木虫 (著名写手)
蛋白还有磷元素的。可以给个例子么

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
耐心说话，好好说话！
8楼2016-09-11 07:46:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyundang

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by kuaile5420 at 2016-09-09 13:17:26
在NCBI种查询基因功能有两种办法：一个是直接在pubmed进行文献搜索，输入这个基因名称+细菌，或者直接输入该基因名称，进入摘要，看是否与增值（繁殖）有关系，如果有的话没就算找到一个基因；另外一种就是在NCBI的 ...

多谢多谢，我查查试试
赞一下 回复此楼
9楼2016-09-11 13:13:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyundang

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by zyfskj at 2016-09-10 14:49:04
请问你菌的生长更快是跟指它通过一些改造以后跟原始菌相比还是？

是指我有不同的培养条件。通过提取总蛋白，可以看到处理组比对照组生长的生物膜更多，这时候已经看到它们增殖、生物膜的生长更快了。
于是我认为它自身的代谢或者繁殖能力应该是增强了的，我想用一个分子生物学层面的数据这个意思：它确实增强了。比如说整体代谢的基因变强了，不过我不知道应该找那些个具有代表性的基因。
赞一下 回复此楼
10楼2016-09-11 13:16:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wuyundang 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 0856求调剂 +5 zhn03 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:58 by peike
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +7 niko- 2026-03-22 7/350 2026-03-25 20:14 by qingfeng258
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +3 小鱼爱有机 2026-03-25 3/150 2026-03-25 20:13 by qingfeng258
[考研] 286求调剂 +11 Faune 2026-03-21 11/550 2026-03-25 10:11 by 雾散后相遇lc
[考研] B区考研调剂 +4 yqdszhdap－ 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:51 by baoball
[考研] 材料学求调剂 +6 Stella_Yao 2026-03-20 6/300 2026-03-25 00:37 by baoball
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考博] 申博26年 +4 八6八68 2026-03-19 4/200 2026-03-24 15:49 by 小Ben呵呵
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 求调剂材料学硕080500，总分289分 5+3 @taotao 2026-03-19 21/1050 2026-03-23 10:17 by 冠c哥
[考研] 一志愿东华大学化学070300，求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 12/600 2026-03-20 12:25 by lidianxing
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭