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shijunqin木虫 (小有名气)
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Lammps中in文件如何连续读入两个data文件 已有1人参与
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我想在in文件中读入两个data文件，可是读完第一个data文件，读入第二个data文件时就会提示 Error: cannot read_data after simulation box is defined (../read_data.cpp:170)，请各位大神指导啊？in文件部分内容和data文件如下 【in文件】 echo both processors 4 4 1 package gpu 2 neigh no newton off on units metal atom_style full bond_style harmonic angle_style harmonic boundary p p m neighbor 2 bin neigh_modify delay 5 neigh_modify exclude type 6 6 #------------create the initial model------------------------ variable water1 string 30A_H2O.data variable water2 string 10A_H2O.data read_data ${water1} read_data ${water2} group water1 type 1 2 variable wax1 equal "lx*3.1e-3" variable way1 equal "ly*2.92e-3" variable waz1 equal "lz*0.518" displace_atoms water1 move ${wax1} ${way1} ${waz1} units box group water2 type 1 2 variable wax2 equal "lx*3.1e-3" variable way2 equal "ly*2.92e-3" variable waz2 equal "lz*0.6364" displace_atoms water2 move ${wax2} ${way2} ${waz2} units box group water union water1 water2 【data文件1】 LAMMPS data file. msi2lmp v3.9.6 / 11 Sep 2014 / CGCMM for 30A_H2O_244^2 180000 atoms 120000 bonds 60000 angles 0 dihedrals 0 impropers 6 atom types 1 bond types 1 angle types -0.07 246.01 xlo xhi -0.07 246.01 ylo yhi -0.50 255.5 zlo zhi Masses 1 15.999400 # o* 2 1.007970 # h* 3 63.546 # Cu 4 63.546 # Cu 5 63.546 # Cu 6 12 # C Atoms # full 1 1 1 -0.820000 12.745627803 12.404175134 2.226094393 0 0 0 # o* 2 1 2 0.410000 12.277690607 11.622376960 1.883749467 0 0 0 # h* 3 1 2 0.410000 12.646508661 12.951163887 1.438594828 0 0 0 # h* 【data文件2】 LAMMPS data file. msi2lmp v3.9.6 / 11 Sep 2014 / CGCMM for 10A_H2O_244^2 60000 atoms 40000 bonds 20000 angles 0 dihedrals 0 impropers 6 atom types 1 bond types 1 angle types #-0.07 246.01 xlo xhi #-0.07 246.01 ylo yhi #-0.50 255.5 zlo zhi Masses 1 15.999400 # o* 2 1.007970 # h* 3 63.546 # Cu 4 63.546 # Cu 5 63.546 # Cu 6 12 # C Bond Coeffs # harmonic 1 540.6336 0.9600 # o*-h* Angle Coeffs # harmonic 1 50.0000 104.5000 # h*-o*-h* Atoms # full 1 1 1 -0.820000 12.745627803 12.404175134 2.226094393 0 0 0 # o* 2 1 2 0.410000 12.277690607 11.622376960 1.883749467 0 0 0 # h* 3 1 2 0.410000 12.646508661 12.951163887 1.438594828 0 0 0 # h* |
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2楼2016-09-08 19:30:49
shijunqin
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shijunqin4楼2016-09-09 12:55:55
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