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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 怎么确定5端和3端
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wzm小情绪

新虫 (正式写手)

[求助] 怎么确定5端和3端 已有1人参与

得到一段序列，在ncbi上比对，反向互补，根据这段序列，设计引物，测序，然后与序列比对，反向互补，与ncbi比对正向互补，这样是不是说明测序为正向，从左到右为5 到3，

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1楼 2016-09-02 12:12:19
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wzm小情绪

新虫 (正式写手)
测序与ncbi比对正向比对上，不是互补

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2楼2016-09-02 12:15:24
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千里两句

新虫 (小有名气)
ncbi上一般默认为5'端，测序回来的结果有时提供的是反向互补序列

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3楼2016-09-02 21:21:32
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千里两句

新虫 (小有名气)
默认5'端开始

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4楼2016-09-02 21:22:13
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wzm小情绪

新虫 (正式写手)
测序的不确定那端是5端，

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5楼2016-09-02 22:13:25
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luckydog52

木虫 (著名写手)
左边是5  如果不对就反向互补。

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自信源于一次次成功的积累
6楼2016-09-05 18:29:21
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luckydog52

木虫 (著名写手)
序列格式永远是左边5’

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自信源于一次次成功的积累
7楼2016-09-05 18:29:41
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cry_2013

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

NCBI上一般是5'-3'端的，你在根据这个推一下哪边是5'端，NCBI上应该不会以互补的方式显示出来吧，而是上一行是比对的序列，下一行是自己的序列
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8楼2016-09-06 10:57:56
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