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Jldbaobei

木虫 (著名写手)

按时毕业找到好工作

[交流] 【求助】对过渡态进行IRC计算,文件20M了,才得出四个点

计算出的过渡态虚频在-120多
然后进行IRC计算,关键字如下:

ub3lyp/6-31G* IRC=(RCFC,MaxPoints=25) Guess=Read Geom=AllCheck Test

结果计算了快要23个小时了,输出文件20M,竟然才找到4个稳定点,我做得计算中只有7个简单原子,不是大体系
这样子正常吗,还是这个过渡态结构找的有问题?我是不是应该把它停掉?

[ Last edited by erylingjet on 2008-12-31 at 21:04 ]
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Jldbaobei

木虫 (著名写手)

按时毕业找到好工作

以为是因为算出来结构的虚频对应某单键旋转震动,初始结构比较接近重叠构象的原因,变将所得过渡态结构绕振动方向旋转了一个较大的角度,再次进行过渡态优化计算,结果算出来的过渡态结构还是先前未调整的样子
请问这个点究竟是不是过渡态呢
如果是的话,为什么进行IRC计算路径这么困难呢
ps:经过14个小时、仅得出4个稳定点的IRC计算直接被偶kill掉了
不知该用什么方法来确定偶计算出的这个过渡态了
请大侠们指教啊
2楼2008-11-17 16:25:23
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hanjunfeng

银虫 (小有名气)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
MaxPoints=25    把25换成100试试
OK
3楼2008-11-24 09:52:09
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gaochao85

铜虫 (正式写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
为什么不用 forward 和 reverse 呢?
4楼2008-11-24 11:21:48
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cysqxr

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
gwdavid(金币+4,VIP+0):兄弟是这方面的高手啊,回答了好多问题了,欢迎常来这里指教!
根据楼主的描述,我觉得还是先确认一下是否过渡态为好。两种方法:1、在两个方向上走IRC, 只需要个出现一个Found的点,然后用这俩点做优化,他们若分别走向了反应物和产物,则证明你的过渡态没问题;2、沿着虚频振动方向,稍微调整一下结构(如果是键的伸缩,则分别增大/减小0.01)得到两个结构,优化,应当走向产物和反应物。这两个优化都不用走到底,走到中途看看,差不多是走向反应物或者产物的结构,就kill掉,可以判定过渡态没问题。
如果是过渡态,因为你的虚频很小,所以IRC计算需要提高精度,减小步长,以确保IRC的顺利进行。
不是过渡态的话,就再加油喽!
5楼2008-11-26 10:14:59
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
楼上说的没错,如果过渡态正确,就调整下步长吧,高斯默认的stepsize为10,你可以将步长调小试试
6楼2009-01-01 09:05:34
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