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Jldbaobei

木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】对过渡态进行IRC计算，文件20M了，才得出四个点

计算出的过渡态虚频在-120多
然后进行IRC计算，关键字如下：

ub3lyp/6-31G* IRC=(RCFC,MaxPoints=25) Guess=Read Geom=AllCheck Test

结果计算了快要23个小时了，输出文件20M，竟然才找到4个稳定点，我做得计算中只有7个简单原子，不是大体系
这样子正常吗，还是这个过渡态结构找的有问题？我是不是应该把它停掉？

[ Last edited by erylingjet on 2008-12-31 at 21:04 ]

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1楼 2008-11-17 12:37:58

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cysqxr

木虫 (小有名气)

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★ ★ ★ ★
gwdavid(金币+4,VIP+0):兄弟是这方面的高手啊，回答了好多问题了，欢迎常来这里指教！

根据楼主的描述，我觉得还是先确认一下是否过渡态为好。两种方法：1、在两个方向上走IRC, 只需要个出现一个Found的点，然后用这俩点做优化，他们若分别走向了反应物和产物，则证明你的过渡态没问题；2、沿着虚频振动方向，稍微调整一下结构（如果是键的伸缩，则分别增大/减小0.01）得到两个结构，优化，应当走向产物和反应物。这两个优化都不用走到底，走到中途看看，差不多是走向反应物或者产物的结构，就kill掉，可以判定过渡态没问题。
如果是过渡态，因为你的虚频很小，所以IRC计算需要提高精度，减小步长，以确保IRC的顺利进行。
不是过渡态的话，就再加油喽！

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5楼2008-11-26 10:14:59

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Jldbaobei

木虫 (著名写手)

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以为是因为算出来结构的虚频对应某单键旋转震动，初始结构比较接近重叠构象的原因，变将所得过渡态结构绕振动方向旋转了一个较大的角度，再次进行过渡态优化计算，结果算出来的过渡态结构还是先前未调整的样子
请问这个点究竟是不是过渡态呢
如果是的话，为什么进行IRC计算路径这么困难呢
ps：经过14个小时、仅得出4个稳定点的IRC计算直接被偶kill掉了
不知该用什么方法来确定偶计算出的这个过渡态了
请大侠们指教啊

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2楼2008-11-17 16:25:23

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