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木木木小头

新虫 (初入文坛)

[求助] 各位大神!求助大神们怎么设计简并引物~ 已有1人参与

我设计了好多次简并引物了~都扩不出来~我研究的植物没有序列~只能根据保守区设计简并引物……求各位大神指点~下面是保守区~
.....WAIARDP.......IPFGAGRRICAG…….GLTLQRA......
谢谢啦……

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点瓣心音

木虫 (小有名气)

实在扩不出来,好像是可以送去公司直接合成基因。

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4楼2016-08-18 10:53:43
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cyhm082

捐助贵宾 (小有名气)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-17 08:38:03
兼并引物本来就很难扩增,你这序列里兼并碱基太多了,不适合扩增

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2楼2016-08-16 22:43:30
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木木木小头

新虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-17 08:38:10
引用回帖:
2楼: Originally posted by cyhm082 at 2016-08-16 22:43:30
兼并引物本来就很难扩增,你这序列里兼并碱基太多了,不适合扩增

嗯嗯~谢谢大神~我再看看别的保守区呢

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3楼2016-08-16 22:46:59
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xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by 点瓣心音 at 2016-08-18 10:53:43
实在扩不出来,好像是可以送去公司直接合成基因。

他连蛋白序列都不知道怎么合成基因呢?LOL

你按照下面这个表来设计引物吧,不过成功的几率很小的。。。
https://en.wikipedia.org/wiki/Codon_degeneracy
你是筛文库吧。。

正向WAIARD---5-'TGGGCNATHGCNCGY(MGR)GAY-3' (共576种可能)
反向IPFGAG----5‘-NCCNGCNCCRAANNGDAT-3‘ (共1536种可能)
正向引物定两条,括号里头的是另外两个编码R的密码子。
祝你好运气吧。。。
5楼2016-08-19 12:53:51
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