24小时热门版块排行榜    

查看: 1331  |  回复: 11

木木木小头

新虫 (初入文坛)

[求助] 各位大神!求助大神们怎么设计简并引物~ 已有1人参与

我设计了好多次简并引物了~都扩不出来~我研究的植物没有序列~只能根据保守区设计简并引物……求各位大神指点~下面是保守区~
.....WAIARDP.......IPFGAGRRICAG…….GLTLQRA......
谢谢啦……

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyhm082

捐助贵宾 (小有名气)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-17 08:38:03
兼并引物本来就很难扩增,你这序列里兼并碱基太多了,不适合扩增

发自小木虫Android客户端
2楼2016-08-16 22:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木木木小头

新虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-17 08:38:10
引用回帖:
2楼: Originally posted by cyhm082 at 2016-08-16 22:43:30
兼并引物本来就很难扩增,你这序列里兼并碱基太多了,不适合扩增

嗯嗯~谢谢大神~我再看看别的保守区呢

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-08-16 22:46:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

点瓣心音

木虫 (小有名气)

实在扩不出来,好像是可以送去公司直接合成基因。

发自小木虫Android客户端
4楼2016-08-18 10:53:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by 点瓣心音 at 2016-08-18 10:53:43
实在扩不出来,好像是可以送去公司直接合成基因。

他连蛋白序列都不知道怎么合成基因呢?LOL

你按照下面这个表来设计引物吧,不过成功的几率很小的。。。
https://en.wikipedia.org/wiki/Codon_degeneracy
你是筛文库吧。。

正向WAIARD---5-'TGGGCNATHGCNCGY(MGR)GAY-3' (共576种可能)
反向IPFGAG----5‘-NCCNGCNCCRAANNGDAT-3‘ (共1536种可能)
正向引物定两条,括号里头的是另外两个编码R的密码子。
祝你好运气吧。。。
5楼2016-08-19 12:53:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)

看看这个帖子下载的文件,完全按同源性统计数据设计了。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6565918&pid=434&target=1#pid434
6楼2016-08-19 14:31:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木木木小头

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xuweitao at 2016-08-19 12:53:51
他连蛋白序列都不知道怎么合成基因呢?LOL

你按照下面这个表来设计引物吧,不过成功的几率很小的。。。
https://en.wikipedia.org/wiki/Codon_degeneracy
你是筛文库吧。。

正向WAIARD---5-'TGGGCNATHGCNC ...

感谢大神~感觉好难啊

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-08-19 23:04:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木木木小头

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xuweitao at 2016-08-19 14:31:16
看看这个帖子下载的文件,完全按同源性统计数据设计了。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6565918&pid=434&target=1#pid434

我白天了看看~还是很感谢大神呐嘿嘿~

发自小木虫IOS客户端
8楼2016-08-19 23:05:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木木木小头

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 点瓣心音 at 2016-08-18 10:53:43
实在扩不出来,好像是可以送去公司直接合成基因。

对哦 我这个是序列都不知道的呢~我再试试吧 感谢大神嘿嘿嘿

发自小木虫IOS客户端
9楼2016-08-19 23:06:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山舞银蛇

铁杆木虫 (正式写手)

你先把这些氨基酸序列blast一下,找同源性比较高的核酸序列,然后设计

发自小木虫Android客户端
核酸提取与Taqman诊断
10楼2016-08-20 09:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 木木木小头 的主题更新
信息提示
请填处理意见