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cigarette

银虫 (小有名气)

[求助] 表面吸附的一些问题 已有1人参与

1、slab加了自旋极化ISPIN,整个体系也加了。没有磁性的被吸附分子不用加了吧?

2、slab优化时没有加偶极校正,slab+adsorbate才加偶极校正,这样做正确么?slab的表面势是平的。

3、结构优化后,受力达到标准,不过total drift超过了,但静态计算又正常。可以接受么?

可能问的太偏,麻烦知道的指点一下,谢谢。
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朱全喜

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cigarette: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2016-08-10 22:32:16
如果你能确定吸附的分子是没有磁性的那么不加SPIN也没事,不然你加上SPIN静态计算一下优化好的分子结构(非SPIN的)看看能量变化也不是多费力的事;你SLAB计算得到的势能曲线在真空处是平的,说明上下两个表面是对称的(也就是非极性表面),因而不需要加偶极矩修正;第三个就不是什么问题,力的收敛标准已达到(当然VASP针对的就是每个原子上的受力看其是否达到收敛标准)除非你进一步提高收敛标准才能改变原有情况,不然即使你再次优化又有何用。所以你还是看看你设置的收敛精度是否能够得到可靠的结果,如果是那就没必要再纠结了。

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2楼2016-08-10 22:17:27
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cigarette

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-08-10 22:17:27
如果你能确定吸附的分子是没有磁性的那么不加SPIN也没事,不然你加上SPIN静态计算一下优化好的分子结构(非SPIN的)看看能量变化也不是多费力的事;你SLAB计算得到的势能曲线在真空处是平的,说明上下两个表面是对称 ...

再问一下,要考虑自旋轨道耦合的话。直接在优化时就加上,可以么?
试了一下,加上以后能量更低,结构也有改变。
但正常情况下,好像是在静态计算中,先读文件的。

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3楼2016-08-10 22:36:52
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朱全喜

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by cigarette at 2016-08-10 22:36:52
再问一下,要考虑自旋轨道耦合的话。直接在优化时就加上,可以么?
试了一下,加上以后能量更低,结构也有改变。
但正常情况下,好像是在静态计算中,先读文件的。
...

为了加快收敛一般采用先不加SOC得到优化的结果,然后再考虑SOC进行优化这样可以提高效率。第二,如果你加上SPIN后分子能量和结构都有变化那么还是要考虑SPIN的,以保证前后是在同样考量下进行的计算。

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4楼2016-08-10 23:42:02
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cigarette

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-08-10 23:42:02
为了加快收敛一般采用先不加SOC得到优化的结果,然后再考虑SOC进行优化这样可以提高效率。第二,如果你加上SPIN后分子能量和结构都有变化那么还是要考虑SPIN的,以保证前后是在同样考量下进行的计算。
...

再再问下。
slab没有极性,而吸附的分子有极性,例如水分子。
最后计算时加上偶极校正,吸附能太小;去掉偶极校正后,吸附能提高0.05eV左右。
是不是因为吸附分子极性较强,表面极化的后果。

这种情况应该如何处理?
5楼2016-08-11 21:42:04
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朱全喜

新虫 (小有名气)

★ ★
蛋蛋小童鞋: 金币+2, 谢谢参与,鼓励积极回答问题者 2016-08-12 10:06:34
引用回帖:
5楼: Originally posted by cigarette at 2016-08-11 21:42:04
再再问下。
slab没有极性,而吸附的分子有极性,例如水分子。
最后计算时加上偶极校正,吸附能太小;去掉偶极校正后,吸附能提高0.05eV左右。
是不是因为吸附分子极性较强,表面极化的后果。

这种情况应该如 ...

加上偶极矩修正是为了得到正确的结果,因为极性表面上下两个slab之间存在着电场使得我们无法再用使用周期性边界条件来处理,这样用常规方法(不加偶极矩修正)计算得到的能量和力都是不对的。

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6楼2016-08-12 07:43:03
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