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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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元元元儿

新虫 (小有名气)

[求助] 已知引物如何查询目的基因的大小? 已有2人参与

在文献上查到的引物,我想知道目的基因的大小,该怎么做?

还有就是有没有做土壤线虫分子鉴定的小伙伴呀?可以分享一下学习经验

@biostar2009 发自小木虫IOS客户端
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hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
元元元儿: 金币+5, 有帮助 2016-08-08 15:57:21
如果扩增片段序列以提交,可以在NCBI  blast试试。
2楼2016-08-07 08:34:35
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
3楼2016-08-07 10:16:12
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元元元儿

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2016-08-07 10:16:12
看我以前的帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7739728

我按照您说的做的,用的也是你的引物序列,为什么还是图三的结果,哪里出问题了吗?难道您帮忙看看^_^
已知引物如何查询目的基因的大小?


已知引物如何查询目的基因的大小?-1


已知引物如何查询目的基因的大小?-2



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4楼2016-08-08 15:54:52
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元元元儿

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-08-07 08:34:35
如果扩增片段序列以提交,可以在NCBI  blast试试。

之前可以查到,现在在blast就没有了,而且出现这个问题
已知引物如何查询目的基因的大小?-3



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5楼2016-08-08 15:56:42
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元元元儿

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 元元元儿 at 2016-08-08 15:54:52
我按照您说的做的,用的也是你的引物序列,为什么还是图三的结果,哪里出问题了吗?难道您帮忙看看^_^



...

麻烦您帮忙看看

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6楼2016-08-08 15:58:07
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-08-09 07:46:18
引用回帖:
6楼: Originally posted by 元元元儿 at 2016-08-08 15:58:07
麻烦您帮忙看看
...

我还额外输入了物种名限定了搜索范围,我看你并没有填。另外n的数目也有影响,太短不行。直接用你自己的引物查找看有什么结果再说,不用验证我的,不同时间提交的任务,结果也会有差异。
7楼2016-08-08 17:07:27
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元元元儿

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by stone2239 at 2016-08-08 17:07:27
我还额外输入了物种名限定了搜索范围,我看你并没有填。另外n的数目也有影响,太短不行。直接用你自己的引物查找看有什么结果再说,不用验证我的,不同时间提交的任务,结果也会有差异。...

嗯嗯,还想问一下您?n是什么意思

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8楼2016-08-08 17:48:50
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 元元元儿 at 2016-08-08 17:48:50
嗯嗯,还想问一下您?n是什么意思
...

n代表任意碱基

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2016-08-08 18:13:41
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元元元儿

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by stone2239 at 2016-08-08 18:13:41
n代表任意碱基...

非常感谢,已经解决了,不过我比对的时候没有?n

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10楼2016-08-08 18:15:28
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