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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 已知引物如何查询目的基因的大小？
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元元元儿

新虫 (小有名气)

[求助] 已知引物如何查询目的基因的大小？ 已有2人参与

在文献上查到的引物，我想知道目的基因的大小，该怎么做？

还有就是有没有做土壤线虫分子鉴定的小伙伴呀？可以分享一下学习经验

@biostar2009 发自小木虫IOS客户端
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1楼 2016-08-06 11:29:17
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hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
元元元儿: 金币+5, ★有帮助 2016-08-08 15:57:21
如果扩增片段序列以提交，可以在NCBI  blast试试。
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2楼2016-08-07 08:34:35
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看我以前的帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7739728
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3楼2016-08-07 10:16:12
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元元元儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2016-08-07 10:16:12
看我以前的帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7739728

我按照您说的做的，用的也是你的引物序列，为什么还是图三的结果，哪里出问题了吗？难道您帮忙看看^_^
已知引物如何查询目的基因的大小？


已知引物如何查询目的基因的大小？-1


已知引物如何查询目的基因的大小？-2



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4楼2016-08-08 15:54:52
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元元元儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-08-07 08:34:35
如果扩增片段序列以提交，可以在NCBI  blast试试。

之前可以查到，现在在blast就没有了，而且出现这个问题
已知引物如何查询目的基因的大小？-3



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5楼2016-08-08 15:56:42
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元元元儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 元元元儿 at 2016-08-08 15:54:52
我按照您说的做的，用的也是你的引物序列，为什么还是图三的结果，哪里出问题了吗？难道您帮忙看看^_^



...

麻烦您帮忙看看

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6楼2016-08-08 15:58:07
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-08-09 07:46:18
引用回帖:
6楼: Originally posted by 元元元儿 at 2016-08-08 15:58:07
麻烦您帮忙看看
...

我还额外输入了物种名限定了搜索范围，我看你并没有填。另外n的数目也有影响，太短不行。直接用你自己的引物查找看有什么结果再说，不用验证我的，不同时间提交的任务，结果也会有差异。
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7楼2016-08-08 17:07:27
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元元元儿

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by stone2239 at 2016-08-08 17:07:27
我还额外输入了物种名限定了搜索范围，我看你并没有填。另外n的数目也有影响，太短不行。直接用你自己的引物查找看有什么结果再说，不用验证我的，不同时间提交的任务，结果也会有差异。...

嗯嗯，还想问一下您?n是什么意思

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8楼2016-08-08 17:48:50
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 元元元儿 at 2016-08-08 17:48:50
嗯嗯，还想问一下您?n是什么意思
...

n代表任意碱基
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元元元儿
9楼2016-08-08 18:13:41
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元元元儿

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by stone2239 at 2016-08-08 18:13:41
n代表任意碱基...

非常感谢，已经解决了，不过我比对的时候没有?n

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10楼2016-08-08 18:15:28
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