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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » P-1 对称性的空间群cif 转换成POSCAR时 变成了P1对称性的空间群了，为什么？！！！
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lisu555

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] P-1 对称性的空间群cif 转换成POSCAR时 变成了P1对称性的空间群了，为什么？！！！ 已有4人参与

P-1 对称性的空间群cif  通过VAESTA转换成POSCAR时 变成了P1对称性的空间群了，为什么？！！！如附件P-1 LiAlPO4F 的cif！回答得好可以追加金币啊！
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    • 2016-08-05 21:18:15, 2.24 K

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1楼 2016-08-05 21:15:29
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漫天飘雪

版主 (知名作家)

认真做事，踏实做人

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
蛋蛋小童鞋: 金币+2, 谢谢 2016-08-06 16:11:35
任何结构通过VAESTA转换成POSCAR时都变成了P1空间群，因为POSCAR不考虑对称性。
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http://blog.sciencenet.cn/u/pfliu89
2楼2016-08-05 23:10:04
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lisu555

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 漫天飘雪 at 2016-08-05 23:10:04
任何结构通过VAESTA转换成POSCAR时都变成了P1空间群，因为POSCAR不考虑对称性。

那这个对计算结果没有影响吗，计算完成以后 是不是要改回原来的对称性啊？
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3楼2016-08-06 09:42:23
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c19940408

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
蛋蛋小童鞋: 金币+1, 谢谢参与 2016-08-06 16:11:00
lisu555: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-08-10 10:11:14
LZ说的空间群变为C1是指计算时变为C1，还是指VESTA自己判别为C1。。如果是后者，直接拿结构去计算，看看计算时的OUTCAR中判定的对称性。如果是前者，可以试试把对称性判别精度调低一点，或者把cif中有效数字位数弄高一点。
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4楼2016-08-06 12:44:28
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lisu555

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by c19940408 at 2016-08-06 12:44:28
LZ说的空间群变为C1是指计算时变为C1，还是指VESTA自己判别为C1。。如果是后者，直接拿结构去计算，看看计算时的OUTCAR中判定的对称性。如果是前者，可以试试把对称性判别精度调低一点，或者把cif中有效数字位数弄高 ...

您的意思是VESTA虽然吧原始的P-1对称性 变成POSCAR时 改成了P1，但是OUTCAR里又会自动由P1对称性 转变成正确的对称性吗（如：原始的P-1对称性）？
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5楼2016-08-06 14:32:46
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lisu555

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lisu555 at 2016-08-06 14:32:46
您的意思是VESTA虽然吧原始的P-1对称性 变成POSCAR时 改成了P1，但是OUTCAR里又会自动由P1对称性 转变成正确的对称性吗（如：原始的P-1对称性）？...

另外OUTCAR中判定的对称性，怎么看？找不到啊！
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6楼2016-08-06 14:38:14
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c19940408

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lisu555 at 2016-08-06 14:38:14
另外OUTCAR中判定的对称性，怎么看？找不到啊！...

试试看OUTCAR里找一下关键词：symm或者group，看看判定的点群，空间群是啥
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7楼2016-08-06 14:49:05
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fanqy1991

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
lisu555: 金币+1, ★有帮助 2016-08-10 10:11:24
nizijimeiyou你自己没有写过POSCAR吗  POSCAR 不考虑对称性，而且对计算结果没有任何影响
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8楼2016-08-07 18:38:22
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朱全喜

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流 2016-08-08 08:27:56
lisu555: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-08-10 10:09:01
CIF文件叫做晶体信息文件，是最为标准和常见的一种晶体结构格式文件。因为它包含基本所有的结构信息：对称性，占位数，元素。而很多其他格式的结构信息文件比如POSCAR，它仅仅包含元素和坐标信息。由于在格式转换过程中，一些坐标（如1/3）用小数形式难以表达清楚却又缺乏对称性限制，所以看起来与原本对称性不同。但是VASP软件在读取坐标信息进行对称性分析时有默认的小数点位置截断和分数坐标处理方式（当然你也可以在INCAR中自行设置），可以准确的判断出原有的对称性，这你可以通过查看OUTCAR文件：grep symmetry OUTCAR对比验证一下。

发自小木虫Android客户端
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9楼2016-08-08 07:47:06
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