24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 336  |  回复: 7
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zwdbordeaux

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】transcriptional factor, gene and protein之间数量关系的研究方法??

最近在忙一个研究方案,主要是想用模型模拟谷物内蛋白质含量的变化。
基本的思路是看TF,然后合成蛋白相关基因,以及蛋白含量变化之间的关系,然后做一个数学模型。
模型对我来说比较熟,但是分子生物学方面比较缺,所以有几个问题请教各位:
1)TF--Gene-Protein他们之间会存在怎样的调控关系。比如说TF含量高了,导致GENE表达提高,然后造成PROTEIN合成提高。
或者还有什么别的关系。我的感觉是他们三者在数量上似乎并不存在什么相关性。不知道该从什么角度找寻他们之间的数量相关性??

2)如何量化三者的量? 我知道PROTEIN可以运用RP-HPLC加以测量,但是TF呢?运用 qRT-PCR吗?请帮忙推荐一个简单明了的关于qRT-PCR原理和功能的解释。再来便是基因的问题,怎么弄?

大体的研究思路?

是否要用到特别的材料(near-isogenic and transgenic lines)?他们怎么用,优点是那些?

多谢解释,或者提供简明的文献资料!时间紧迫,多谢多谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

Truthcomesoutoferrormoreeasilythanoutofconfusion
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zwdbordeaux

木虫 (正式写手)

如果不能线性化就用非线性方程也没有问题,但是需要找出一些基本的关系来。
Truthcomesoutoferrormoreeasilythanoutofconfusion
6楼2008-11-13 21:11:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
lwf991229(金币+2,VIP+0):感谢参与讨论~~
很难量化
目前的说法都是呈相关性而无法定量
因为一个基因可能有多个转录因子调控
翻译水平也存在调控,翻译后修饰以及降解都受到调控
所以是几乎无法量化的
2楼2008-11-13 20:27:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zwdbordeaux

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2008-11-13 20:27:
很难量化
目前的说法都是呈相关性而无法定量
因为一个基因可能有多个转录因子调控
翻译水平也存在调控,翻译后修饰以及降解都受到调控
所以是几乎无法量化的

呵呵,如果想量化呢? 比如说我有一个TF的near-isogenic lines 和transgenic lines,然后根据他们丰度与目标蛋白之间的相关性,是否可以得出这个tf与该蛋白含量之间的关系。之后我们改变该tf的丰度,然后利用它作为因变量,然后预测蛋白含量的关系。
请问near-isogenic line一般都用来做什么,有什么优点,怎么构建?
Truthcomesoutoferrormoreeasilythanoutofconfusion
3楼2008-11-13 20:37:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

基因调控有正调控和负调控的
拿最最简单的乳糖操纵子来说
乳糖和葡萄糖的浓度都很重要,其实就是lac I的表达程度以及cAMP水平
这些东西这么复杂有可能量化么……
除非是指定某个培养条件和生理状态
转录因子的结合位点的特性也能影响表达水平
比如有n个结合位点,结合位点距离转录起始位点的距离,染色质的构象等等
这些可不是什么线性化的东西
4楼2008-11-13 20:51:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工考研调剂 +11 孅華 2026-03-22 11/550 2026-03-27 08:35 by hypershenger
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 349求调剂 +5 杰斯塔里斯 2026-03-21 5/250 2026-03-27 00:31 by wxiongid
[考研] 材料学硕333求调剂 +7 北道巷 2026-03-24 7/350 2026-03-27 00:30 by wxiongid
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 10/500 2026-03-26 22:37 by 学员8dgXkO
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 321求调剂 +5 材料cailiao 2026-03-21 5/250 2026-03-26 20:41 by fmesaito
[考研] 329求调剂 +5 1() 2026-03-22 5/250 2026-03-26 20:40 by fmesaito
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap- 2026-03-22 10/500 2026-03-26 13:11 by 公瑾逍遥
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[考研] 290分调剂求助 +3 吉祥止止陈 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:58 by barlinike
[考研] 化学调剂 +6 yzysaa 2026-03-21 6/300 2026-03-25 09:27 by aa331100
[考研] 材料学求调剂 +6 Stella_Yao 2026-03-20 6/300 2026-03-25 00:37 by baoball
[考研] 调剂 +4 13853210211 2026-03-24 4/200 2026-03-24 19:44 by ms629
[考研] 070300化学求调剂 +9 苑豆豆 2026-03-20 9/450 2026-03-24 17:15 by licg0208
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-23 4/200 2026-03-23 21:25 by pswait
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 328求调剂 +4 LHHL66 2026-03-23 4/200 2026-03-23 14:55 by lbsjt
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见